Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnga4Q3UW12 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnga4Q3UW12 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnga4Q3UW12 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnga4Q3UW12 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnga4Q3UW12 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnga4Q3UW12 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnga4Q3UW12 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnga4Q3UW12 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnga4Q3UW12 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnga4Q3UW12 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnga4Q3UW12 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnga4Q3UW12 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnga4Q3UW12 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnga4Q3UW12 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnga4Q3UW12 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnga4Q3UW12 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnga4Q3UW12 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnga4Q3UW12 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnga4Q3UW12 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnga4Q3UW12 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnga4Q3UW12 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnga4Q3UW12 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnga4Q3UW12 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnga4Q3UW12 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnga4Q3UW12 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnga4Q3UW12 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnga4Q3UW12 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnga4Q3UW12 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnga4Q3UW12 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnga4Q3UW12 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnga4Q3UW12 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnga4Q3UW12 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnga4Q3UW12 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnga4Q3UW12 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnga4Q3UW12 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnga4Q3UW12 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnga4Q3UW12 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnga4Q3UW12 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnga4Q3UW12 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnga4Q3UW12 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnga4Q3UW12 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnga4Q3UW12 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnga4Q3UW12 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnga4Q3UW12 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnga4Q3UW12 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnga4Q3UW12 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnga4Q3UW12 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnga4Q3UW12 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnga4Q3UW12 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnga4Q3UW12 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnga4Q3UW12 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnga4Q3UW12 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnga4Q3UW12 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnga4Q3UW12 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnga4Q3UW12 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnga4Q3UW12 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnga4Q3UW12 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnga4Q3UW12 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnga4Q3UW12 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnga4Q3UW12 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnga4Q3UW12 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnga4Q3UW12 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnga4Q3UW12 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnga4Q3UW12 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnga4Q3UW12 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnga4Q3UW12 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnga4Q3UW12 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnga4Q3UW12 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnga4Q3UW12 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnga4Q3UW12 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnga4Q3UW12 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnga4Q3UW12 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnga4Q3UW12 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnga4Q3UW12 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnga4Q3UW12 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnga4Q3UW12 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnga4Q3UW12 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnga4Q3UW12 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnga4Q3UW12 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnga4Q3UW12 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnga4Q3UW12 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnga4Q3UW12 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnga4Q3UW12 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnga4Q3UW12 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnga4Q3UW12 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnga4Q3UW12 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnga4Q3UW12 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnga4Q3UW12 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnga4Q3UW12 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnga4Q3UW12 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnga4Q3UW12 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnga4Q3UW12 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnga4Q3UW12 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnga4Q3UW12 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnga4Q3UW12 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnga4Q3UW12 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnga4Q3UW12 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnga4Q3UW12 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnga4Q3UW12 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms