Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acsf3Q3URE1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acsf3Q3URE1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acsf3Q3URE1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acsf3Q3URE1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acsf3Q3URE1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Acsf3Q3URE1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Acsf3Q3URE1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acsf3Q3URE1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acsf3Q3URE1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acsf3Q3URE1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acsf3Q3URE1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acsf3Q3URE1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acsf3Q3URE1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acsf3Q3URE1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acsf3Q3URE1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acsf3Q3URE1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acsf3Q3URE1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acsf3Q3URE1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Acsf3Q3URE1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acsf3Q3URE1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acsf3Q3URE1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acsf3Q3URE1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acsf3Q3URE1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acsf3Q3URE1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acsf3Q3URE1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Acsf3Q3URE1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Acsf3Q3URE1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acsf3Q3URE1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acsf3Q3URE1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acsf3Q3URE1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acsf3Q3URE1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acsf3Q3URE1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acsf3Q3URE1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acsf3Q3URE1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acsf3Q3URE1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acsf3Q3URE1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acsf3Q3URE1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsf3Q3URE1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsf3Q3URE1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsf3Q3URE1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsf3Q3URE1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsf3Q3URE1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsf3Q3URE1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsf3Q3URE1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsf3Q3URE1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Acsf3Q3URE1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acsf3Q3URE1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acsf3Q3URE1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Acsf3Q3URE1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acsf3Q3URE1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acsf3Q3URE1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acsf3Q3URE1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Acsf3Q3URE1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acsf3Q3URE1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acsf3Q3URE1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Acsf3Q3URE1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Acsf3Q3URE1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Acsf3Q3URE1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acsf3Q3URE1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acsf3Q3URE1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acsf3Q3URE1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acsf3Q3URE1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acsf3Q3URE1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acsf3Q3URE1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acsf3Q3URE1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Acsf3Q3URE1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Acsf3Q3URE1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Acsf3Q3URE1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Acsf3Q3URE1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Acsf3Q3URE1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Acsf3Q3URE1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Acsf3Q3URE1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Acsf3Q3URE1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Acsf3Q3URE1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Acsf3Q3URE1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acsf3Q3URE1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acsf3Q3URE1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Acsf3Q3URE1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acsf3Q3URE1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acsf3Q3URE1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acsf3Q3URE1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acsf3Q3URE1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acsf3Q3URE1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acsf3Q3URE1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acsf3Q3URE1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acsf3Q3URE1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acsf3Q3URE1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Acsf3Q3URE1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Acsf3Q3URE1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acsf3Q3URE1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acsf3Q3URE1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acsf3Q3URE1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acsf3Q3URE1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acsf3Q3URE1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acsf3Q3URE1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acsf3Q3URE1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acsf3Q3URE1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Acsf3Q3URE1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acsf3Q3URE1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms