Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Edc4Q3UJB9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Edc4Q3UJB9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Edc4Q3UJB9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Edc4Q3UJB9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Edc4Q3UJB9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Edc4Q3UJB9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Edc4Q3UJB9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Edc4Q3UJB9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Edc4Q3UJB9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Edc4Q3UJB9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Edc4Q3UJB9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Edc4Q3UJB9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Edc4Q3UJB9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Edc4Q3UJB9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Edc4Q3UJB9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Edc4Q3UJB9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Edc4Q3UJB9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Edc4Q3UJB9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Edc4Q3UJB9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Edc4Q3UJB9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Edc4Q3UJB9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Edc4Q3UJB9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Edc4Q3UJB9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Edc4Q3UJB9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Edc4Q3UJB9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Edc4Q3UJB9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Edc4Q3UJB9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Edc4Q3UJB9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Edc4Q3UJB9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Edc4Q3UJB9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Edc4Q3UJB9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Edc4Q3UJB9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Edc4Q3UJB9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Edc4Q3UJB9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Edc4Q3UJB9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Edc4Q3UJB9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Edc4Q3UJB9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Edc4Q3UJB9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Edc4Q3UJB9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Edc4Q3UJB9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Edc4Q3UJB9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Edc4Q3UJB9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Edc4Q3UJB9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Edc4Q3UJB9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Edc4Q3UJB9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Edc4Q3UJB9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Edc4Q3UJB9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Edc4Q3UJB9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Edc4Q3UJB9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Edc4Q3UJB9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Edc4Q3UJB9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Edc4Q3UJB9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
Edc4Q3UJB9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Edc4Q3UJB9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Edc4Q3UJB9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Edc4Q3UJB9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Edc4Q3UJB9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Edc4Q3UJB9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Edc4Q3UJB9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Edc4Q3UJB9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Edc4Q3UJB9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Edc4Q3UJB9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Edc4Q3UJB9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Edc4Q3UJB9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Edc4Q3UJB9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Edc4Q3UJB9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Edc4Q3UJB9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Edc4Q3UJB9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Edc4Q3UJB9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Edc4Q3UJB9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Edc4Q3UJB9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Edc4Q3UJB9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Edc4Q3UJB9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Edc4Q3UJB9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Edc4Q3UJB9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Edc4Q3UJB9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Edc4Q3UJB9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Edc4Q3UJB9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Edc4Q3UJB9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Edc4Q3UJB9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Edc4Q3UJB9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Edc4Q3UJB9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Edc4Q3UJB9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Edc4Q3UJB9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Edc4Q3UJB9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Edc4Q3UJB9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Edc4Q3UJB9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Edc4Q3UJB9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Edc4Q3UJB9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Edc4Q3UJB9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Edc4Q3UJB9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Edc4Q3UJB9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Edc4Q3UJB9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Edc4Q3UJB9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Edc4Q3UJB9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Edc4Q3UJB9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Edc4Q3UJB9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Edc4Q3UJB9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Edc4Q3UJB9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms