Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnep1r1Q3UJ81 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnep1r1Q3UJ81 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnep1r1Q3UJ81 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnep1r1Q3UJ81 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnep1r1Q3UJ81 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnep1r1Q3UJ81 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnep1r1Q3UJ81 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnep1r1Q3UJ81 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnep1r1Q3UJ81 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnep1r1Q3UJ81 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms