Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Lmod2Q3UHZ5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Lmod2Q3UHZ5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Lmod2Q3UHZ5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Lmod2Q3UHZ5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Lmod2Q3UHZ5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Lmod2Q3UHZ5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Lmod2Q3UHZ5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Lmod2Q3UHZ5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Lmod2Q3UHZ5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Lmod2Q3UHZ5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Lmod2Q3UHZ5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Lmod2Q3UHZ5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Lmod2Q3UHZ5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Lmod2Q3UHZ5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Lmod2Q3UHZ5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Lmod2Q3UHZ5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Lmod2Q3UHZ5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
Lmod2Q3UHZ5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Lmod2Q3UHZ5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Lmod2Q3UHZ5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Lmod2Q3UHZ5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Lmod2Q3UHZ5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Lmod2Q3UHZ5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Lmod2Q3UHZ5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Lmod2Q3UHZ5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Lmod2Q3UHZ5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Lmod2Q3UHZ5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Lmod2Q3UHZ5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Lmod2Q3UHZ5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Lmod2Q3UHZ5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Lmod2Q3UHZ5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Lmod2Q3UHZ5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
Lmod2Q3UHZ5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Lmod2Q3UHZ5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Lmod2Q3UHZ5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Lmod2Q3UHZ5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Lmod2Q3UHZ5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Lmod2Q3UHZ5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Lmod2Q3UHZ5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Lmod2Q3UHZ5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Lmod2Q3UHZ5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Lmod2Q3UHZ5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
Lmod2Q3UHZ5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Lmod2Q3UHZ5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Lmod2Q3UHZ5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Lmod2Q3UHZ5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Lmod2Q3UHZ5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Lmod2Q3UHZ5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Lmod2Q3UHZ5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Lmod2Q3UHZ5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Lmod2Q3UHZ5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Lmod2Q3UHZ5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Lmod2Q3UHZ5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Lmod2Q3UHZ5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Lmod2Q3UHZ5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Lmod2Q3UHZ5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Lmod2Q3UHZ5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Lmod2Q3UHZ5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Lmod2Q3UHZ5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Lmod2Q3UHZ5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Lmod2Q3UHZ5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Lmod2Q3UHZ5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Lmod2Q3UHZ5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Lmod2Q3UHZ5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Lmod2Q3UHZ5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Lmod2Q3UHZ5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Lmod2Q3UHZ5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Lmod2Q3UHZ5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Lmod2Q3UHZ5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Lmod2Q3UHZ5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Lmod2Q3UHZ5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Lmod2Q3UHZ5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Lmod2Q3UHZ5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Lmod2Q3UHZ5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Lmod2Q3UHZ5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Lmod2Q3UHZ5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Lmod2Q3UHZ5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Lmod2Q3UHZ5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Lmod2Q3UHZ5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Lmod2Q3UHZ5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Lmod2Q3UHZ5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Lmod2Q3UHZ5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Lmod2Q3UHZ5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Lmod2Q3UHZ5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Lmod2Q3UHZ5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Lmod2Q3UHZ5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Lmod2Q3UHZ5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Lmod2Q3UHZ5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Lmod2Q3UHZ5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Lmod2Q3UHZ5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Lmod2Q3UHZ5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Lmod2Q3UHZ5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Lmod2Q3UHZ5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Lmod2Q3UHZ5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Lmod2Q3UHZ5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Lmod2Q3UHZ5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Lmod2Q3UHZ5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Lmod2Q3UHZ5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms