Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rsph3aQ3UFY4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rsph3aQ3UFY4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsph3aQ3UFY4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsph3aQ3UFY4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsph3aQ3UFY4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsph3aQ3UFY4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsph3aQ3UFY4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsph3aQ3UFY4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsph3aQ3UFY4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsph3aQ3UFY4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsph3aQ3UFY4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rsph3aQ3UFY4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rsph3aQ3UFY4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rsph3aQ3UFY4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rsph3aQ3UFY4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rsph3aQ3UFY4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rsph3aQ3UFY4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rsph3aQ3UFY4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rsph3aQ3UFY4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rsph3aQ3UFY4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rsph3aQ3UFY4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rsph3aQ3UFY4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rsph3aQ3UFY4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rsph3aQ3UFY4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rsph3aQ3UFY4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rsph3aQ3UFY4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rsph3aQ3UFY4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rsph3aQ3UFY4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rsph3aQ3UFY4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rsph3aQ3UFY4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rsph3aQ3UFY4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Rsph3aQ3UFY4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rsph3aQ3UFY4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rsph3aQ3UFY4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rsph3aQ3UFY4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rsph3aQ3UFY4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rsph3aQ3UFY4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rsph3aQ3UFY4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rsph3aQ3UFY4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rsph3aQ3UFY4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rsph3aQ3UFY4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rsph3aQ3UFY4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rsph3aQ3UFY4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rsph3aQ3UFY4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Rsph3aQ3UFY4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rsph3aQ3UFY4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rsph3aQ3UFY4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rsph3aQ3UFY4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rsph3aQ3UFY4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rsph3aQ3UFY4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rsph3aQ3UFY4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rsph3aQ3UFY4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rsph3aQ3UFY4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rsph3aQ3UFY4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rsph3aQ3UFY4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rsph3aQ3UFY4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rsph3aQ3UFY4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rsph3aQ3UFY4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rsph3aQ3UFY4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rsph3aQ3UFY4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rsph3aQ3UFY4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rsph3aQ3UFY4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rsph3aQ3UFY4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Rsph3aQ3UFY4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rsph3aQ3UFY4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rsph3aQ3UFY4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rsph3aQ3UFY4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rsph3aQ3UFY4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rsph3aQ3UFY4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Rsph3aQ3UFY4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rsph3aQ3UFY4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rsph3aQ3UFY4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rsph3aQ3UFY4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rsph3aQ3UFY4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rsph3aQ3UFY4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rsph3aQ3UFY4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rsph3aQ3UFY4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rsph3aQ3UFY4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rsph3aQ3UFY4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rsph3aQ3UFY4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rsph3aQ3UFY4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rsph3aQ3UFY4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rsph3aQ3UFY4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Rsph3aQ3UFY4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Rsph3aQ3UFY4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rsph3aQ3UFY4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rsph3aQ3UFY4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rsph3aQ3UFY4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rsph3aQ3UFY4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rsph3aQ3UFY4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rsph3aQ3UFY4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rsph3aQ3UFY4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rsph3aQ3UFY4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Rsph3aQ3UFY4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rsph3aQ3UFY4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rsph3aQ3UFY4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rsph3aQ3UFY4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rsph3aQ3UFY4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms