Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm4dQ3U2K5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm4dQ3U2K5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm4dQ3U2K5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm4dQ3U2K5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm4dQ3U2K5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm4dQ3U2K5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm4dQ3U2K5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm4dQ3U2K5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm4dQ3U2K5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm4dQ3U2K5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm4dQ3U2K5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm4dQ3U2K5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm4dQ3U2K5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm4dQ3U2K5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm4dQ3U2K5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm4dQ3U2K5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm4dQ3U2K5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm4dQ3U2K5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm4dQ3U2K5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm4dQ3U2K5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm4dQ3U2K5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm4dQ3U2K5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm4dQ3U2K5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm4dQ3U2K5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm4dQ3U2K5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm4dQ3U2K5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm4dQ3U2K5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm4dQ3U2K5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm4dQ3U2K5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm4dQ3U2K5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm4dQ3U2K5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm4dQ3U2K5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm4dQ3U2K5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm4dQ3U2K5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm4dQ3U2K5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm4dQ3U2K5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm4dQ3U2K5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm4dQ3U2K5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm4dQ3U2K5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm4dQ3U2K5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm4dQ3U2K5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm4dQ3U2K5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm4dQ3U2K5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm4dQ3U2K5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm4dQ3U2K5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm4dQ3U2K5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm4dQ3U2K5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm4dQ3U2K5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm4dQ3U2K5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm4dQ3U2K5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm4dQ3U2K5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm4dQ3U2K5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm4dQ3U2K5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm4dQ3U2K5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm4dQ3U2K5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm4dQ3U2K5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm4dQ3U2K5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdm4dQ3U2K5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdm4dQ3U2K5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdm4dQ3U2K5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdm4dQ3U2K5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm4dQ3U2K5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm4dQ3U2K5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm4dQ3U2K5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm4dQ3U2K5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm4dQ3U2K5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm4dQ3U2K5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm4dQ3U2K5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm4dQ3U2K5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm4dQ3U2K5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm4dQ3U2K5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm4dQ3U2K5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm4dQ3U2K5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm4dQ3U2K5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm4dQ3U2K5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm4dQ3U2K5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm4dQ3U2K5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm4dQ3U2K5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm4dQ3U2K5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm4dQ3U2K5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm4dQ3U2K5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm4dQ3U2K5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm4dQ3U2K5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm4dQ3U2K5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm4dQ3U2K5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm4dQ3U2K5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm4dQ3U2K5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm4dQ3U2K5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm4dQ3U2K5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm4dQ3U2K5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms