Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TraddQ3U0V2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TraddQ3U0V2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TraddQ3U0V2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TraddQ3U0V2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TraddQ3U0V2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TraddQ3U0V2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TraddQ3U0V2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TraddQ3U0V2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TraddQ3U0V2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TraddQ3U0V2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TraddQ3U0V2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TraddQ3U0V2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TraddQ3U0V2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TraddQ3U0V2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TraddQ3U0V2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TraddQ3U0V2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TraddQ3U0V2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TraddQ3U0V2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TraddQ3U0V2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TraddQ3U0V2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TraddQ3U0V2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TraddQ3U0V2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TraddQ3U0V2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TraddQ3U0V2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TraddQ3U0V2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TraddQ3U0V2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TraddQ3U0V2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TraddQ3U0V2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TraddQ3U0V2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TraddQ3U0V2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TraddQ3U0V2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TraddQ3U0V2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TraddQ3U0V2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TraddQ3U0V2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TraddQ3U0V2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TraddQ3U0V2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TraddQ3U0V2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TraddQ3U0V2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TraddQ3U0V2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TraddQ3U0V2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TraddQ3U0V2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TraddQ3U0V2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TraddQ3U0V2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TraddQ3U0V2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TraddQ3U0V2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TraddQ3U0V2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TraddQ3U0V2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TraddQ3U0V2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TraddQ3U0V2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TraddQ3U0V2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TraddQ3U0V2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TraddQ3U0V2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TraddQ3U0V2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TraddQ3U0V2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TraddQ3U0V2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TraddQ3U0V2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TraddQ3U0V2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TraddQ3U0V2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TraddQ3U0V2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TraddQ3U0V2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TraddQ3U0V2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TraddQ3U0V2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TraddQ3U0V2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TraddQ3U0V2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TraddQ3U0V2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TraddQ3U0V2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TraddQ3U0V2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TraddQ3U0V2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TraddQ3U0V2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TraddQ3U0V2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TraddQ3U0V2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TraddQ3U0V2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TraddQ3U0V2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TraddQ3U0V2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TraddQ3U0V2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TraddQ3U0V2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TraddQ3U0V2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TraddQ3U0V2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TraddQ3U0V2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TraddQ3U0V2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TraddQ3U0V2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TraddQ3U0V2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TraddQ3U0V2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TraddQ3U0V2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TraddQ3U0V2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TraddQ3U0V2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TraddQ3U0V2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TraddQ3U0V2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TraddQ3U0V2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TraddQ3U0V2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TraddQ3U0V2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TraddQ3U0V2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TraddQ3U0V2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TraddQ3U0V2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TraddQ3U0V2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TraddQ3U0V2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TraddQ3U0V2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TraddQ3U0V2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TraddQ3U0V2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200.6 ms