Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc102aQ3TMW1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc102aQ3TMW1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc102aQ3TMW1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc102aQ3TMW1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc102aQ3TMW1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc102aQ3TMW1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc102aQ3TMW1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc102aQ3TMW1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc102aQ3TMW1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc102aQ3TMW1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc102aQ3TMW1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc102aQ3TMW1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc102aQ3TMW1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc102aQ3TMW1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc102aQ3TMW1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc102aQ3TMW1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc102aQ3TMW1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc102aQ3TMW1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc102aQ3TMW1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc102aQ3TMW1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc102aQ3TMW1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc102aQ3TMW1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc102aQ3TMW1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc102aQ3TMW1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc102aQ3TMW1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc102aQ3TMW1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc102aQ3TMW1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc102aQ3TMW1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc102aQ3TMW1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc102aQ3TMW1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms