Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Uri1Q3TLD5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uri1Q3TLD5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uri1Q3TLD5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Uri1Q3TLD5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Uri1Q3TLD5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Uri1Q3TLD5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Uri1Q3TLD5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Uri1Q3TLD5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Uri1Q3TLD5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Uri1Q3TLD5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Uri1Q3TLD5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Uri1Q3TLD5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Uri1Q3TLD5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Uri1Q3TLD5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Uri1Q3TLD5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Uri1Q3TLD5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Uri1Q3TLD5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Uri1Q3TLD5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Uri1Q3TLD5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Uri1Q3TLD5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Uri1Q3TLD5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Uri1Q3TLD5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uri1Q3TLD5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uri1Q3TLD5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Uri1Q3TLD5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Uri1Q3TLD5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Uri1Q3TLD5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Uri1Q3TLD5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Uri1Q3TLD5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Uri1Q3TLD5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Uri1Q3TLD5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Uri1Q3TLD5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Uri1Q3TLD5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Uri1Q3TLD5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Uri1Q3TLD5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Uri1Q3TLD5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Uri1Q3TLD5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uri1Q3TLD5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uri1Q3TLD5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Uri1Q3TLD5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Uri1Q3TLD5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Uri1Q3TLD5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Uri1Q3TLD5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Uri1Q3TLD5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Uri1Q3TLD5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Uri1Q3TLD5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Uri1Q3TLD5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Uri1Q3TLD5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Uri1Q3TLD5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uri1Q3TLD5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uri1Q3TLD5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uri1Q3TLD5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uri1Q3TLD5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Uri1Q3TLD5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Uri1Q3TLD5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Uri1Q3TLD5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Uri1Q3TLD5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Uri1Q3TLD5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Uri1Q3TLD5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uri1Q3TLD5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uri1Q3TLD5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uri1Q3TLD5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uri1Q3TLD5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uri1Q3TLD5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Uri1Q3TLD5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Uri1Q3TLD5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Uri1Q3TLD5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Uri1Q3TLD5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Uri1Q3TLD5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Uri1Q3TLD5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Uri1Q3TLD5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Uri1Q3TLD5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Uri1Q3TLD5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Uri1Q3TLD5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Uri1Q3TLD5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Uri1Q3TLD5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Uri1Q3TLD5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Uri1Q3TLD5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Uri1Q3TLD5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Uri1Q3TLD5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Uri1Q3TLD5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Uri1Q3TLD5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Uri1Q3TLD5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Uri1Q3TLD5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Uri1Q3TLD5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Uri1Q3TLD5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uri1Q3TLD5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uri1Q3TLD5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uri1Q3TLD5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uri1Q3TLD5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uri1Q3TLD5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uri1Q3TLD5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uri1Q3TLD5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uri1Q3TLD5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uri1Q3TLD5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uri1Q3TLD5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uri1Q3TLD5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uri1Q3TLD5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uri1Q3TLD5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms