Protein–RNA interactions for Protein: Q08879

Fbln1, Fibulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbln1Q08879 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Fbln1Q08879 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Fbln1Q08879 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Fbln1Q08879 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Fbln1Q08879 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Fbln1Q08879 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Fbln1Q08879 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Fbln1Q08879 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Fbln1Q08879 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Fbln1Q08879 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Fbln1Q08879 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Fbln1Q08879 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Fbln1Q08879 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Fbln1Q08879 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27,91■■■□□ 2,06
Fbln1Q08879 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Fbln1Q08879 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27,9■■■□□ 2,06
Fbln1Q08879 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,89■■■□□ 2,06
Fbln1Q08879 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Fbln1Q08879 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Fbln1Q08879 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Fbln1Q08879 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Fbln1Q08879 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Fbln1Q08879 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Fbln1Q08879 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Fbln1Q08879 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Fbln1Q08879 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Fbln1Q08879 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Fbln1Q08879 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Fbln1Q08879 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Fbln1Q08879 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Fbln1Q08879 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Fbln1Q08879 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Fbln1Q08879 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Fbln1Q08879 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Fbln1Q08879 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Fbln1Q08879 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Fbln1Q08879 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Fbln1Q08879 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Fbln1Q08879 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Fbln1Q08879 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Fbln1Q08879 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Fbln1Q08879 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Fbln1Q08879 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Fbln1Q08879 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Fbln1Q08879 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Fbln1Q08879 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Fbln1Q08879 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Fbln1Q08879 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Fbln1Q08879 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Fbln1Q08879 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Fbln1Q08879 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Fbln1Q08879 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Fbln1Q08879 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Fbln1Q08879 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Fbln1Q08879 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Fbln1Q08879 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Fbln1Q08879 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Fbln1Q08879 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Fbln1Q08879 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Fbln1Q08879 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27,7■■■□□ 2,02
Fbln1Q08879 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Fbln1Q08879 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Fbln1Q08879 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Fbln1Q08879 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Fbln1Q08879 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Fbln1Q08879 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Fbln1Q08879 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Fbln1Q08879 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Fbln1Q08879 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Fbln1Q08879 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Fbln1Q08879 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,66■■■□□ 2,02
Fbln1Q08879 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Fbln1Q08879 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Fbln1Q08879 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Fbln1Q08879 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Fbln1Q08879 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Fbln1Q08879 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Fbln1Q08879 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Fbln1Q08879 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Fbln1Q08879 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27,6■■■□□ 2,01
Fbln1Q08879 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Fbln1Q08879 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Fbln1Q08879 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Fbln1Q08879 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Fbln1Q08879 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Fbln1Q08879 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27,56■■■□□ 2
Fbln1Q08879 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27,56■■■□□ 2
Fbln1Q08879 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
Fbln1Q08879 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Fbln1Q08879 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27,55■■■□□ 2
Fbln1Q08879 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27,55■■■□□ 2
Fbln1Q08879 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27,55■■■□□ 2
Fbln1Q08879 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Fbln1Q08879 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Fbln1Q08879 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27,53■■■□□ 2
Fbln1Q08879 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Fbln1Q08879 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Fbln1Q08879 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Fbln1Q08879 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■■□□ 2
Fbln1Q08879 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms