Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ebf1Q07802 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ebf1Q07802 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ebf1Q07802 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ebf1Q07802 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ebf1Q07802 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ebf1Q07802 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ebf1Q07802 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ebf1Q07802 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ebf1Q07802 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ebf1Q07802 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ebf1Q07802 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ebf1Q07802 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ebf1Q07802 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ebf1Q07802 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ebf1Q07802 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ebf1Q07802 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ebf1Q07802 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ebf1Q07802 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ebf1Q07802 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ebf1Q07802 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ebf1Q07802 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ebf1Q07802 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ebf1Q07802 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ebf1Q07802 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ebf1Q07802 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ebf1Q07802 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ebf1Q07802 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ebf1Q07802 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ebf1Q07802 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ebf1Q07802 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ebf1Q07802 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ebf1Q07802 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ebf1Q07802 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ebf1Q07802 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ebf1Q07802 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ebf1Q07802 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ebf1Q07802 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ebf1Q07802 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ebf1Q07802 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ebf1Q07802 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ebf1Q07802 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ebf1Q07802 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ebf1Q07802 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ebf1Q07802 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ebf1Q07802 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ebf1Q07802 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ebf1Q07802 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ebf1Q07802 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ebf1Q07802 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ebf1Q07802 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ebf1Q07802 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ebf1Q07802 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ebf1Q07802 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ebf1Q07802 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ebf1Q07802 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ebf1Q07802 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ebf1Q07802 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ebf1Q07802 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ebf1Q07802 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ebf1Q07802 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ebf1Q07802 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ebf1Q07802 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ebf1Q07802 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ebf1Q07802 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ebf1Q07802 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ebf1Q07802 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ebf1Q07802 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ebf1Q07802 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ebf1Q07802 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ebf1Q07802 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ebf1Q07802 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ebf1Q07802 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ebf1Q07802 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ebf1Q07802 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ebf1Q07802 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ebf1Q07802 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ebf1Q07802 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ebf1Q07802 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ebf1Q07802 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ebf1Q07802 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ebf1Q07802 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ebf1Q07802 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ebf1Q07802 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ebf1Q07802 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ebf1Q07802 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ebf1Q07802 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ebf1Q07802 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ebf1Q07802 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ebf1Q07802 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ebf1Q07802 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ebf1Q07802 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ebf1Q07802 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ebf1Q07802 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ebf1Q07802 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ebf1Q07802 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ebf1Q07802 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ebf1Q07802 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ebf1Q07802 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ebf1Q07802 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms