Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col9a2Q07643 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col9a2Q07643 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col9a2Q07643 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col9a2Q07643 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col9a2Q07643 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col9a2Q07643 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col9a2Q07643 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col9a2Q07643 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col9a2Q07643 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col9a2Q07643 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col9a2Q07643 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Col9a2Q07643 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col9a2Q07643 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Col9a2Q07643 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col9a2Q07643 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col9a2Q07643 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col9a2Q07643 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col9a2Q07643 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col9a2Q07643 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Col9a2Q07643 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Col9a2Q07643 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col9a2Q07643 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col9a2Q07643 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col9a2Q07643 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col9a2Q07643 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col9a2Q07643 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Col9a2Q07643 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col9a2Q07643 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col9a2Q07643 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col9a2Q07643 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col9a2Q07643 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col9a2Q07643 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col9a2Q07643 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col9a2Q07643 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col9a2Q07643 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col9a2Q07643 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col9a2Q07643 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col9a2Q07643 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col9a2Q07643 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col9a2Q07643 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col9a2Q07643 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col9a2Q07643 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col9a2Q07643 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col9a2Q07643 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col9a2Q07643 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col9a2Q07643 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col9a2Q07643 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col9a2Q07643 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col9a2Q07643 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col9a2Q07643 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col9a2Q07643 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col9a2Q07643 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col9a2Q07643 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col9a2Q07643 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col9a2Q07643 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col9a2Q07643 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col9a2Q07643 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col9a2Q07643 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col9a2Q07643 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col9a2Q07643 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col9a2Q07643 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Col9a2Q07643 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col9a2Q07643 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col9a2Q07643 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Col9a2Q07643 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col9a2Q07643 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col9a2Q07643 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Col9a2Q07643 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col9a2Q07643 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col9a2Q07643 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col9a2Q07643 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col9a2Q07643 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col9a2Q07643 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col9a2Q07643 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col9a2Q07643 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col9a2Q07643 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col9a2Q07643 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col9a2Q07643 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col9a2Q07643 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col9a2Q07643 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Col9a2Q07643 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col9a2Q07643 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col9a2Q07643 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col9a2Q07643 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col9a2Q07643 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col9a2Q07643 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col9a2Q07643 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col9a2Q07643 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col9a2Q07643 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col9a2Q07643 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col9a2Q07643 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col9a2Q07643 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col9a2Q07643 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col9a2Q07643 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col9a2Q07643 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Col9a2Q07643 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col9a2Q07643 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Col9a2Q07643 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col9a2Q07643 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms