Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Top1Q04750 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Top1Q04750 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Top1Q04750 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top1Q04750 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top1Q04750 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top1Q04750 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top1Q04750 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top1Q04750 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top1Q04750 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top1Q04750 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top1Q04750 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Top1Q04750 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Top1Q04750 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Top1Q04750 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Top1Q04750 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top1Q04750 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top1Q04750 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top1Q04750 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top1Q04750 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top1Q04750 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top1Q04750 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top1Q04750 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top1Q04750 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top1Q04750 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top1Q04750 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top1Q04750 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top1Q04750 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top1Q04750 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top1Q04750 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Top1Q04750 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Top1Q04750 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Top1Q04750 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Top1Q04750 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Top1Q04750 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top1Q04750 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top1Q04750 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Top1Q04750 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Top1Q04750 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top1Q04750 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top1Q04750 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top1Q04750 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top1Q04750 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top1Q04750 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top1Q04750 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top1Q04750 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top1Q04750 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top1Q04750 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top1Q04750 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top1Q04750 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top1Q04750 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top1Q04750 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top1Q04750 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Top1Q04750 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Top1Q04750 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Top1Q04750 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top1Q04750 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top1Q04750 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top1Q04750 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top1Q04750 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Top1Q04750 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top1Q04750 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top1Q04750 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top1Q04750 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top1Q04750 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top1Q04750 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Top1Q04750 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top1Q04750 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top1Q04750 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Top1Q04750 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Top1Q04750 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Top1Q04750 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Top1Q04750 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top1Q04750 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top1Q04750 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top1Q04750 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top1Q04750 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top1Q04750 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top1Q04750 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top1Q04750 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top1Q04750 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top1Q04750 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top1Q04750 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Top1Q04750 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top1Q04750 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top1Q04750 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top1Q04750 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top1Q04750 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top1Q04750 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top1Q04750 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top1Q04750 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Top1Q04750 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top1Q04750 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top1Q04750 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top1Q04750 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top1Q04750 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top1Q04750 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top1Q04750 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top1Q04750 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top1Q04750 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms