Protein–RNA interactions for Protein: Q04336

YMR196W, Uncharacterized protein YMR196W, yeastyeast

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR196WQ04336 SDH8YBR269C 417 nt12.04□□□□□ -0.48
YMR196WQ04336 YKR005CYKR005C 1578 nt12.04□□□□□ -0.48
YMR196WQ04336 HTS1YPR033C 1641 nt12.04□□□□□ -0.48
YMR196WQ04336 YER188WYER188W 720 nt12.03□□□□□ -0.48
YMR196WQ04336 BMT5YIL096C 1011 nt12.02□□□□□ -0.49
YMR196WQ04336 MOB1YIL106W 945 nt12.02□□□□□ -0.49
YMR196WQ04336 CYC3YAL039C 810 nt12.02□□□□□ -0.49
YMR196WQ04336 FUB1YCR076C 753 nt12.01□□□□□ -0.49
YMR196WQ04336 OXA1YER154W 1209 nt12.01□□□□□ -0.49
YMR196WQ04336 FCY1YPR062W 477 nt11.99□□□□□ -0.49
YMR196WQ04336 THP3YPR045C 1413 nt11.99□□□□□ -0.49
YMR196WQ04336 RSC8YFR037C 1674 nt11.98□□□□□ -0.49
YMR196WQ04336 EDC2YER035W 438 nt11.98□□□□□ -0.49
YMR196WQ04336 DDI1YER143W 1287 nt11.98□□□□□ -0.49
YMR196WQ04336 KAE1YKR038C 1161 nt11.98□□□□□ -0.49
YMR196WQ04336 ADH3YMR083W 1128 nt11.98□□□□□ -0.49
YMR196WQ04336 LSM5YER146W 282 nt11.97□□□□□ -0.49
YMR196WQ04336 BET2YPR176C 978 nt11.97□□□□□ -0.49
YMR196WQ04336 IMO32YGR031W 1029 nt11.96□□□□□ -0.49
YMR196WQ04336 TGA1tA(UGC)A 73 nt11.94□□□□□ -0.5
YMR196WQ04336 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt11.94□□□□□ -0.5
YMR196WQ04336 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt11.94□□□□□ -0.5
YMR196WQ04336 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt11.94□□□□□ -0.5
YMR196WQ04336 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt11.94□□□□□ -0.5
YMR196WQ04336 PHB2YGR231C 933 nt11.93□□□□□ -0.5
YMR196WQ04336 ABZ2YMR289W 1125 nt11.92□□□□□ -0.5
YMR196WQ04336 MRP1YDR347W 966 nt11.91□□□□□ -0.5
YMR196WQ04336 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt11.91□□□□□ -0.5
YMR196WQ04336 SRN2YLR119W 642 nt11.9□□□□□ -0.5
YMR196WQ04336 PRE5YMR314W 705 nt11.9□□□□□ -0.5
YMR196WQ04336 UFO1YML088W 2007 nt11.89□□□□□ -0.51
YMR196WQ04336 YPL247CYPL247C 1572 nt11.88□□□□□ -0.51
YMR196WQ04336 LCP5YER127W 1074 nt11.88□□□□□ -0.51
YMR196WQ04336 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt11.88□□□□□ -0.51
YMR196WQ04336 URA6YKL024C 615 nt11.88□□□□□ -0.51
YMR196WQ04336 EMC3YKL207W 762 nt11.88□□□□□ -0.51
YMR196WQ04336 SHY1YGR112W 1170 nt11.87□□□□□ -0.51
YMR196WQ04336 YGR210CYGR210C 1236 nt11.87□□□□□ -0.51
YMR196WQ04336 FSH2YMR222C 672 nt11.87□□□□□ -0.51
YMR196WQ04336 BAP3YDR046C 1815 nt11.86□□□□□ -0.51
YMR196WQ04336 OSH7YHR001W 1314 nt11.86□□□□□ -0.51
YMR196WQ04336 YJL225CYJL225C 5277 nt11.84□□□□□ -0.51
YMR196WQ04336 PET8YNL003C 855 nt11.83□□□□□ -0.52
YMR196WQ04336 SOL2YCR073W-A 948 nt11.82□□□□□ -0.52
YMR196WQ04336 DLD2YDL178W 1593 nt11.8□□□□□ -0.52
YMR196WQ04336 ADE8YDR408C 645 nt11.8□□□□□ -0.52
YMR196WQ04336 YKR012CYKR012C 378 nt11.79□□□□□ -0.52
YMR196WQ04336 URH1YDR400W 1023 nt11.78□□□□□ -0.52
YMR196WQ04336 TOM20YGR082W 552 nt11.78□□□□□ -0.52
YMR196WQ04336 ENO2YHR174W 1314 nt11.78□□□□□ -0.52
YMR196WQ04336 PRP4YPR178W 1398 nt11.78□□□□□ -0.52
YMR196WQ04336 TVP23YDR084C 600 nt11.76□□□□□ -0.53
YMR196WQ04336 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt11.76□□□□□ -0.53
YMR196WQ04336 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt11.76□□□□□ -0.53
YMR196WQ04336 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt11.76□□□□□ -0.53
YMR196WQ04336 SUP51tL(UAA)J 84 nt11.76□□□□□ -0.53
YMR196WQ04336 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt11.76□□□□□ -0.53
YMR196WQ04336 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt11.76□□□□□ -0.53
YMR196WQ04336 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt11.76□□□□□ -0.53
YMR196WQ04336 ZRT3YKL175W 1512 nt11.76□□□□□ -0.53
YMR196WQ04336 RIM2YBR192W 1134 nt11.75□□□□□ -0.53
YMR196WQ04336 ERO1YML130C 1692 nt11.75□□□□□ -0.53
YMR196WQ04336 SRP102YKL154W 735 nt11.74□□□□□ -0.53
YMR196WQ04336 TPC1YGR096W 945 nt11.73□□□□□ -0.53
YMR196WQ04336 YLR280CYLR280C 351 nt11.73□□□□□ -0.53
YMR196WQ04336 YMR210WYMR210W 1350 nt11.73□□□□□ -0.53
YMR196WQ04336 DIG1YPL049C 1359 nt11.73□□□□□ -0.53
YMR196WQ04336 RRT8YOL048C 1029 nt11.71□□□□□ -0.53
YMR196WQ04336 FLR1YBR008C 1647 nt11.71□□□□□ -0.54
YMR196WQ04336 GDH1YOR375C 1365 nt11.7□□□□□ -0.54
YMR196WQ04336 YJL160CYJL160C 864 nt11.7□□□□□ -0.54
YMR196WQ04336 ENO1YGR254W 1314 nt11.69□□□□□ -0.54
YMR196WQ04336 ASP3-1YLR155C 1089 nt11.69□□□□□ -0.54
YMR196WQ04336 ASP3-2YLR157C 1089 nt11.69□□□□□ -0.54
YMR196WQ04336 ASP3-3YLR158C 1089 nt11.69□□□□□ -0.54
YMR196WQ04336 ASP3-4YLR160C 1089 nt11.69□□□□□ -0.54
YMR196WQ04336 YPL108WYPL108W 507 nt11.67□□□□□ -0.54
YMR196WQ04336 DPS1YLL018C 1674 nt11.66□□□□□ -0.54
YMR196WQ04336 AI5_BETAQ0075 1065 nt11.64□□□□□ -0.55
YMR196WQ04336 YJR154WYJR154W 1041 nt11.64□□□□□ -0.55
YMR196WQ04336 FRE6YLL051C 2139 nt11.63□□□□□ -0.55
YMR196WQ04336 YPS3YLR121C 1527 nt11.62□□□□□ -0.55
YMR196WQ04336 YDR455CYDR455C 309 nt11.62□□□□□ -0.55
YMR196WQ04336 AMF1YOR378W 1548 nt11.6□□□□□ -0.55
YMR196WQ04336 SDS24YBR214W 1584 nt11.6□□□□□ -0.55
YMR196WQ04336 LEU2YCL018W 1095 nt11.6□□□□□ -0.55
YMR196WQ04336 YDR509WYDR509W 348 nt11.59□□□□□ -0.55
YMR196WQ04336 COS10YNR075W 1125 nt11.59□□□□□ -0.55
YMR196WQ04336 ERG13YML126C 1476 nt11.58□□□□□ -0.56
YMR196WQ04336 YBL095WYBL095W 813 nt11.58□□□□□ -0.56
YMR196WQ04336 TAT2YOL020W 1779 nt11.57□□□□□ -0.56
YMR196WQ04336 HEM13YDR044W 987 nt11.56□□□□□ -0.56
YMR196WQ04336 OPI3YJR073C 621 nt11.56□□□□□ -0.56
YMR196WQ04336 FMS1YMR020W 1527 nt11.55□□□□□ -0.56
YMR196WQ04336 ARP10YDR106W 855 nt11.55□□□□□ -0.56
YMR196WQ04336 LSB6YJL100W 1824 nt11.55□□□□□ -0.56
YMR196WQ04336 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.55□□□□□ -0.56
YMR196WQ04336 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.55□□□□□ -0.56
YMR196WQ04336 TAD2YJL035C 753 nt11.52□□□□□ -0.57
YMR196WQ04336 SPP2YOR148C 558 nt11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 72.2 ms