Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Scg2Q03517 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Scg2Q03517 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Scg2Q03517 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Scg2Q03517 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Scg2Q03517 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Scg2Q03517 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Scg2Q03517 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Scg2Q03517 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Scg2Q03517 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Scg2Q03517 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scg2Q03517 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scg2Q03517 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Scg2Q03517 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scg2Q03517 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Scg2Q03517 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Scg2Q03517 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Scg2Q03517 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Scg2Q03517 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
Scg2Q03517 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Scg2Q03517 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Scg2Q03517 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Scg2Q03517 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Scg2Q03517 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scg2Q03517 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scg2Q03517 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scg2Q03517 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scg2Q03517 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scg2Q03517 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Scg2Q03517 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Scg2Q03517 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Scg2Q03517 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Scg2Q03517 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Scg2Q03517 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Scg2Q03517 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Scg2Q03517 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Scg2Q03517 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scg2Q03517 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scg2Q03517 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scg2Q03517 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scg2Q03517 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scg2Q03517 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Scg2Q03517 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Scg2Q03517 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Scg2Q03517 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Scg2Q03517 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Scg2Q03517 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Scg2Q03517 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scg2Q03517 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scg2Q03517 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scg2Q03517 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scg2Q03517 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Scg2Q03517 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Scg2Q03517 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Scg2Q03517 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Scg2Q03517 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Scg2Q03517 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Scg2Q03517 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Scg2Q03517 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Scg2Q03517 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Scg2Q03517 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Scg2Q03517 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Scg2Q03517 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Scg2Q03517 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Scg2Q03517 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Scg2Q03517 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Scg2Q03517 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Scg2Q03517 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Scg2Q03517 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scg2Q03517 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scg2Q03517 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scg2Q03517 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Scg2Q03517 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Scg2Q03517 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Scg2Q03517 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scg2Q03517 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Scg2Q03517 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scg2Q03517 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scg2Q03517 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scg2Q03517 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Scg2Q03517 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scg2Q03517 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scg2Q03517 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scg2Q03517 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scg2Q03517 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scg2Q03517 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Scg2Q03517 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Scg2Q03517 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Scg2Q03517 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scg2Q03517 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scg2Q03517 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scg2Q03517 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scg2Q03517 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scg2Q03517 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scg2Q03517 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scg2Q03517 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Scg2Q03517 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Scg2Q03517 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Scg2Q03517 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Scg2Q03517 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms