Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
Gjb5Q02739 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gjb5Q02739 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gjb5Q02739 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb5Q02739 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb5Q02739 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gjb5Q02739 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gjb5Q02739 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjb5Q02739 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjb5Q02739 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gjb5Q02739 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gjb5Q02739 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gjb5Q02739 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gjb5Q02739 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjb5Q02739 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjb5Q02739 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjb5Q02739 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjb5Q02739 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjb5Q02739 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjb5Q02739 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjb5Q02739 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gjb5Q02739 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gjb5Q02739 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gjb5Q02739 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gjb5Q02739 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjb5Q02739 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjb5Q02739 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gjb5Q02739 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gjb5Q02739 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gjb5Q02739 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gjb5Q02739 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gjb5Q02739 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gjb5Q02739 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gjb5Q02739 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gjb5Q02739 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gjb5Q02739 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gjb5Q02739 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gjb5Q02739 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gjb5Q02739 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gjb5Q02739 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gjb5Q02739 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gjb5Q02739 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gjb5Q02739 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gjb5Q02739 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gjb5Q02739 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gjb5Q02739 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gjb5Q02739 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gjb5Q02739 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gjb5Q02739 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Gjb5Q02739 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gjb5Q02739 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gjb5Q02739 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gjb5Q02739 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gjb5Q02739 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gjb5Q02739 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gjb5Q02739 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gjb5Q02739 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gjb5Q02739 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gjb5Q02739 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gjb5Q02739 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gjb5Q02739 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gjb5Q02739 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gjb5Q02739 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gjb5Q02739 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjb5Q02739 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjb5Q02739 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjb5Q02739 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gjb5Q02739 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gjb5Q02739 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjb5Q02739 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjb5Q02739 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjb5Q02739 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjb5Q02739 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjb5Q02739 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjb5Q02739 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjb5Q02739 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjb5Q02739 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjb5Q02739 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gjb5Q02739 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gjb5Q02739 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gjb5Q02739 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gjb5Q02739 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gjb5Q02739 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjb5Q02739 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjb5Q02739 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjb5Q02739 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjb5Q02739 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gjb5Q02739 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gjb5Q02739 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gjb5Q02739 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gjb5Q02739 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gjb5Q02739 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gjb5Q02739 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gjb5Q02739 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gjb5Q02739 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gjb5Q02739 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gjb5Q02739 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gjb5Q02739 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjb5Q02739 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjb5Q02739 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms