Protein–RNA interactions for Protein: Q00342

Flt3, Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3, mousemouse

Predictions only

Length 1,000 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt3Q00342 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Flt3Q00342 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Flt3Q00342 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Flt3Q00342 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Flt3Q00342 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Flt3Q00342 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Flt3Q00342 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Flt3Q00342 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Flt3Q00342 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Flt3Q00342 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Flt3Q00342 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Flt3Q00342 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Flt3Q00342 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Flt3Q00342 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Flt3Q00342 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Flt3Q00342 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Flt3Q00342 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Flt3Q00342 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Flt3Q00342 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Flt3Q00342 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Flt3Q00342 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Flt3Q00342 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Flt3Q00342 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Flt3Q00342 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Flt3Q00342 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Flt3Q00342 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Flt3Q00342 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Flt3Q00342 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Flt3Q00342 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Flt3Q00342 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Flt3Q00342 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Flt3Q00342 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Flt3Q00342 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Flt3Q00342 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Flt3Q00342 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Flt3Q00342 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Flt3Q00342 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Flt3Q00342 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Flt3Q00342 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Flt3Q00342 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Flt3Q00342 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Flt3Q00342 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Flt3Q00342 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Flt3Q00342 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Flt3Q00342 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Flt3Q00342 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Flt3Q00342 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Flt3Q00342 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Flt3Q00342 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Flt3Q00342 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Flt3Q00342 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Flt3Q00342 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Flt3Q00342 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Flt3Q00342 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Flt3Q00342 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Flt3Q00342 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Flt3Q00342 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Flt3Q00342 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Flt3Q00342 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Flt3Q00342 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Flt3Q00342 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Flt3Q00342 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Flt3Q00342 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Flt3Q00342 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Flt3Q00342 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Flt3Q00342 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Flt3Q00342 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Flt3Q00342 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Flt3Q00342 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Flt3Q00342 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Flt3Q00342 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Flt3Q00342 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Flt3Q00342 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Flt3Q00342 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Flt3Q00342 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Flt3Q00342 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Flt3Q00342 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Flt3Q00342 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Flt3Q00342 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Flt3Q00342 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Flt3Q00342 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Flt3Q00342 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Flt3Q00342 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Flt3Q00342 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Flt3Q00342 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Flt3Q00342 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Flt3Q00342 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Flt3Q00342 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Flt3Q00342 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Flt3Q00342 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Flt3Q00342 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Flt3Q00342 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Flt3Q00342 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Flt3Q00342 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Flt3Q00342 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Flt3Q00342 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Flt3Q00342 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Flt3Q00342 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Flt3Q00342 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Flt3Q00342 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms