Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cry1P97784 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cry1P97784 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cry1P97784 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cry1P97784 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cry1P97784 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cry1P97784 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cry1P97784 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cry1P97784 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cry1P97784 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cry1P97784 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cry1P97784 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cry1P97784 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cry1P97784 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cry1P97784 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cry1P97784 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cry1P97784 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Cry1P97784 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cry1P97784 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cry1P97784 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cry1P97784 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cry1P97784 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cry1P97784 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cry1P97784 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cry1P97784 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cry1P97784 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cry1P97784 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cry1P97784 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cry1P97784 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cry1P97784 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cry1P97784 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cry1P97784 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cry1P97784 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cry1P97784 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cry1P97784 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cry1P97784 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cry1P97784 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cry1P97784 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cry1P97784 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cry1P97784 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cry1P97784 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cry1P97784 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cry1P97784 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cry1P97784 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cry1P97784 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cry1P97784 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cry1P97784 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cry1P97784 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cry1P97784 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cry1P97784 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cry1P97784 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cry1P97784 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cry1P97784 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cry1P97784 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cry1P97784 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cry1P97784 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cry1P97784 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cry1P97784 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cry1P97784 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cry1P97784 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cry1P97784 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cry1P97784 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cry1P97784 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cry1P97784 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cry1P97784 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cry1P97784 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cry1P97784 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cry1P97784 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cry1P97784 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cry1P97784 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cry1P97784 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cry1P97784 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cry1P97784 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cry1P97784 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cry1P97784 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cry1P97784 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cry1P97784 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cry1P97784 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cry1P97784 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cry1P97784 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cry1P97784 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cry1P97784 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cry1P97784 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cry1P97784 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cry1P97784 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cry1P97784 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cry1P97784 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cry1P97784 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cry1P97784 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cry1P97784 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cry1P97784 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cry1P97784 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cry1P97784 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cry1P97784 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cry1P97784 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cry1P97784 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cry1P97784 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cry1P97784 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cry1P97784 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cry1P97784 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms