Protein–RNA interactions for Protein: P97503

Nkx3-2, Homeobox protein Nkx-3.2, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-2P97503 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx3-2P97503 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx3-2P97503 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx3-2P97503 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx3-2P97503 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx3-2P97503 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx3-2P97503 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx3-2P97503 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx3-2P97503 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx3-2P97503 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx3-2P97503 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx3-2P97503 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx3-2P97503 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx3-2P97503 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx3-2P97503 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx3-2P97503 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx3-2P97503 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx3-2P97503 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx3-2P97503 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx3-2P97503 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx3-2P97503 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx3-2P97503 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx3-2P97503 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx3-2P97503 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx3-2P97503 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx3-2P97503 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx3-2P97503 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx3-2P97503 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx3-2P97503 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx3-2P97503 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx3-2P97503 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx3-2P97503 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx3-2P97503 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx3-2P97503 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx3-2P97503 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx3-2P97503 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx3-2P97503 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx3-2P97503 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx3-2P97503 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx3-2P97503 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx3-2P97503 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx3-2P97503 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx3-2P97503 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx3-2P97503 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx3-2P97503 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx3-2P97503 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx3-2P97503 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx3-2P97503 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx3-2P97503 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx3-2P97503 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx3-2P97503 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx3-2P97503 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx3-2P97503 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx3-2P97503 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx3-2P97503 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx3-2P97503 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx3-2P97503 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx3-2P97503 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx3-2P97503 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nkx3-2P97503 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx3-2P97503 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx3-2P97503 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx3-2P97503 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx3-2P97503 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx3-2P97503 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx3-2P97503 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx3-2P97503 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx3-2P97503 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx3-2P97503 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx3-2P97503 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx3-2P97503 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx3-2P97503 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx3-2P97503 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx3-2P97503 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx3-2P97503 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx3-2P97503 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx3-2P97503 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx3-2P97503 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx3-2P97503 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx3-2P97503 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nkx3-2P97503 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx3-2P97503 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx3-2P97503 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx3-2P97503 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx3-2P97503 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx3-2P97503 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx3-2P97503 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx3-2P97503 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx3-2P97503 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx3-2P97503 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx3-2P97503 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx3-2P97503 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx3-2P97503 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx3-2P97503 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx3-2P97503 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx3-2P97503 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx3-2P97503 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx3-2P97503 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx3-2P97503 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx3-2P97503 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms