Protein–RNA interactions for Protein: P97464

Ext1, Exostosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ext1P97464 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ext1P97464 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ext1P97464 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ext1P97464 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ext1P97464 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ext1P97464 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ext1P97464 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ext1P97464 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ext1P97464 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ext1P97464 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ext1P97464 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ext1P97464 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ext1P97464 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ext1P97464 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ext1P97464 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ext1P97464 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ext1P97464 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ext1P97464 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ext1P97464 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ext1P97464 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ext1P97464 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ext1P97464 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ext1P97464 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ext1P97464 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ext1P97464 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ext1P97464 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ext1P97464 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ext1P97464 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ext1P97464 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ext1P97464 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ext1P97464 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ext1P97464 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ext1P97464 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ext1P97464 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ext1P97464 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ext1P97464 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ext1P97464 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ext1P97464 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ext1P97464 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ext1P97464 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ext1P97464 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ext1P97464 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ext1P97464 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ext1P97464 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ext1P97464 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ext1P97464 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ext1P97464 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ext1P97464 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ext1P97464 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ext1P97464 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ext1P97464 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ext1P97464 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ext1P97464 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ext1P97464 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ext1P97464 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ext1P97464 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ext1P97464 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ext1P97464 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ext1P97464 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ext1P97464 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ext1P97464 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ext1P97464 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ext1P97464 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ext1P97464 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ext1P97464 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ext1P97464 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ext1P97464 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ext1P97464 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ext1P97464 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ext1P97464 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ext1P97464 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ext1P97464 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ext1P97464 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ext1P97464 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ext1P97464 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ext1P97464 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ext1P97464 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ext1P97464 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ext1P97464 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ext1P97464 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ext1P97464 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ext1P97464 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ext1P97464 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ext1P97464 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ext1P97464 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ext1P97464 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ext1P97464 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ext1P97464 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ext1P97464 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ext1P97464 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ext1P97464 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ext1P97464 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ext1P97464 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ext1P97464 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ext1P97464 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ext1P97464 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ext1P97464 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ext1P97464 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ext1P97464 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ext1P97464 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms