Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ElocP83940 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ElocP83940 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ElocP83940 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ElocP83940 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ElocP83940 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ElocP83940 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ElocP83940 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ElocP83940 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ElocP83940 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ElocP83940 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ElocP83940 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ElocP83940 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ElocP83940 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ElocP83940 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ElocP83940 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ElocP83940 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ElocP83940 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ElocP83940 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ElocP83940 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ElocP83940 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ElocP83940 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ElocP83940 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ElocP83940 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ElocP83940 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ElocP83940 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ElocP83940 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ElocP83940 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ElocP83940 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ElocP83940 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ElocP83940 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ElocP83940 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ElocP83940 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ElocP83940 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ElocP83940 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ElocP83940 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ElocP83940 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ElocP83940 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ElocP83940 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ElocP83940 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ElocP83940 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ElocP83940 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ElocP83940 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ElocP83940 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ElocP83940 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ElocP83940 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ElocP83940 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ElocP83940 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ElocP83940 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ElocP83940 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ElocP83940 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ElocP83940 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ElocP83940 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ElocP83940 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ElocP83940 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ElocP83940 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ElocP83940 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ElocP83940 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ElocP83940 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ElocP83940 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ElocP83940 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ElocP83940 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ElocP83940 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ElocP83940 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ElocP83940 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ElocP83940 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ElocP83940 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ElocP83940 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ElocP83940 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ElocP83940 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ElocP83940 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ElocP83940 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ElocP83940 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ElocP83940 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ElocP83940 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ElocP83940 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ElocP83940 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ElocP83940 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ElocP83940 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ElocP83940 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ElocP83940 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ElocP83940 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ElocP83940 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ElocP83940 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ElocP83940 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ElocP83940 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ElocP83940 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ElocP83940 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ElocP83940 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ElocP83940 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ElocP83940 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ElocP83940 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ElocP83940 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ElocP83940 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ElocP83940 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ElocP83940 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ElocP83940 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ElocP83940 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ElocP83940 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ElocP83940 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms