Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pkn1P70268 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pkn1P70268 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pkn1P70268 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pkn1P70268 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pkn1P70268 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pkn1P70268 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pkn1P70268 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pkn1P70268 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pkn1P70268 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pkn1P70268 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pkn1P70268 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pkn1P70268 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pkn1P70268 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pkn1P70268 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pkn1P70268 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pkn1P70268 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pkn1P70268 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pkn1P70268 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pkn1P70268 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pkn1P70268 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pkn1P70268 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pkn1P70268 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Pkn1P70268 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pkn1P70268 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pkn1P70268 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pkn1P70268 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pkn1P70268 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pkn1P70268 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pkn1P70268 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkn1P70268 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkn1P70268 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pkn1P70268 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pkn1P70268 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pkn1P70268 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkn1P70268 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkn1P70268 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pkn1P70268 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkn1P70268 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkn1P70268 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkn1P70268 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkn1P70268 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkn1P70268 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkn1P70268 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkn1P70268 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pkn1P70268 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pkn1P70268 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pkn1P70268 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkn1P70268 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkn1P70268 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkn1P70268 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkn1P70268 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pkn1P70268 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pkn1P70268 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pkn1P70268 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkn1P70268 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkn1P70268 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkn1P70268 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkn1P70268 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkn1P70268 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pkn1P70268 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pkn1P70268 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pkn1P70268 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Pkn1P70268 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pkn1P70268 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pkn1P70268 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pkn1P70268 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkn1P70268 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkn1P70268 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkn1P70268 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkn1P70268 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkn1P70268 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pkn1P70268 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkn1P70268 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkn1P70268 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkn1P70268 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkn1P70268 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pkn1P70268 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pkn1P70268 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pkn1P70268 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pkn1P70268 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pkn1P70268 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pkn1P70268 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pkn1P70268 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pkn1P70268 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pkn1P70268 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pkn1P70268 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pkn1P70268 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pkn1P70268 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pkn1P70268 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkn1P70268 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkn1P70268 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Pkn1P70268 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pkn1P70268 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pkn1P70268 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pkn1P70268 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Pkn1P70268 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkn1P70268 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkn1P70268 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkn1P70268 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms