Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Barhl1P63157 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Barhl1P63157 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Barhl1P63157 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Barhl1P63157 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Barhl1P63157 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Barhl1P63157 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Barhl1P63157 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Barhl1P63157 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Barhl1P63157 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Barhl1P63157 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Barhl1P63157 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Barhl1P63157 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Barhl1P63157 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Barhl1P63157 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Barhl1P63157 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Barhl1P63157 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Barhl1P63157 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Barhl1P63157 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Barhl1P63157 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Barhl1P63157 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Barhl1P63157 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Barhl1P63157 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Barhl1P63157 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Barhl1P63157 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Barhl1P63157 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Barhl1P63157 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Barhl1P63157 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Barhl1P63157 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Barhl1P63157 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Barhl1P63157 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Barhl1P63157 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Barhl1P63157 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Barhl1P63157 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Barhl1P63157 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Barhl1P63157 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Barhl1P63157 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Barhl1P63157 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Barhl1P63157 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Barhl1P63157 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Barhl1P63157 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Barhl1P63157 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Barhl1P63157 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Barhl1P63157 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Barhl1P63157 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Barhl1P63157 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Barhl1P63157 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Barhl1P63157 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Barhl1P63157 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Barhl1P63157 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Barhl1P63157 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Barhl1P63157 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Barhl1P63157 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Barhl1P63157 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Barhl1P63157 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Barhl1P63157 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Barhl1P63157 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Barhl1P63157 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Barhl1P63157 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Barhl1P63157 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Barhl1P63157 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Barhl1P63157 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Barhl1P63157 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Barhl1P63157 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Barhl1P63157 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Barhl1P63157 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Barhl1P63157 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Barhl1P63157 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Barhl1P63157 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Barhl1P63157 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Barhl1P63157 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Barhl1P63157 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Barhl1P63157 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Barhl1P63157 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Barhl1P63157 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Barhl1P63157 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Barhl1P63157 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Barhl1P63157 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Barhl1P63157 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Barhl1P63157 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Barhl1P63157 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Barhl1P63157 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Barhl1P63157 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Barhl1P63157 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Barhl1P63157 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Barhl1P63157 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Barhl1P63157 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Barhl1P63157 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Barhl1P63157 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Barhl1P63157 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Barhl1P63157 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Barhl1P63157 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Barhl1P63157 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Barhl1P63157 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Barhl1P63157 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Barhl1P63157 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Barhl1P63157 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Barhl1P63157 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Barhl1P63157 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Barhl1P63157 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms