Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tra2bP62996 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tra2bP62996 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tra2bP62996 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tra2bP62996 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tra2bP62996 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tra2bP62996 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tra2bP62996 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tra2bP62996 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tra2bP62996 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tra2bP62996 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tra2bP62996 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tra2bP62996 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tra2bP62996 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tra2bP62996 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tra2bP62996 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tra2bP62996 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tra2bP62996 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tra2bP62996 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tra2bP62996 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tra2bP62996 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tra2bP62996 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tra2bP62996 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tra2bP62996 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tra2bP62996 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tra2bP62996 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tra2bP62996 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tra2bP62996 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tra2bP62996 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tra2bP62996 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tra2bP62996 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tra2bP62996 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tra2bP62996 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tra2bP62996 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tra2bP62996 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tra2bP62996 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tra2bP62996 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tra2bP62996 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tra2bP62996 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tra2bP62996 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tra2bP62996 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tra2bP62996 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tra2bP62996 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tra2bP62996 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tra2bP62996 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tra2bP62996 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tra2bP62996 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tra2bP62996 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tra2bP62996 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tra2bP62996 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tra2bP62996 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tra2bP62996 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tra2bP62996 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tra2bP62996 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tra2bP62996 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tra2bP62996 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tra2bP62996 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tra2bP62996 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tra2bP62996 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tra2bP62996 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tra2bP62996 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tra2bP62996 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tra2bP62996 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tra2bP62996 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tra2bP62996 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tra2bP62996 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tra2bP62996 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tra2bP62996 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tra2bP62996 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tra2bP62996 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tra2bP62996 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tra2bP62996 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tra2bP62996 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tra2bP62996 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tra2bP62996 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tra2bP62996 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tra2bP62996 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tra2bP62996 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tra2bP62996 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tra2bP62996 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tra2bP62996 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tra2bP62996 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tra2bP62996 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tra2bP62996 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tra2bP62996 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tra2bP62996 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tra2bP62996 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tra2bP62996 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tra2bP62996 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tra2bP62996 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tra2bP62996 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tra2bP62996 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms