Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl39P62892 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl39P62892 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl39P62892 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl39P62892 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl39P62892 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpl39P62892 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl39P62892 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl39P62892 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl39P62892 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl39P62892 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl39P62892 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl39P62892 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl39P62892 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl39P62892 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl39P62892 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl39P62892 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl39P62892 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl39P62892 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl39P62892 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl39P62892 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl39P62892 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl39P62892 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl39P62892 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl39P62892 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl39P62892 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl39P62892 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl39P62892 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl39P62892 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl39P62892 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl39P62892 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl39P62892 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl39P62892 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl39P62892 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl39P62892 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl39P62892 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl39P62892 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl39P62892 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl39P62892 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl39P62892 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl39P62892 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl39P62892 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl39P62892 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl39P62892 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl39P62892 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl39P62892 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl39P62892 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl39P62892 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl39P62892 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl39P62892 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl39P62892 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl39P62892 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl39P62892 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl39P62892 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl39P62892 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl39P62892 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl39P62892 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms