Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rps29P62274 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rps29P62274 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rps29P62274 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rps29P62274 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rps29P62274 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rps29P62274 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rps29P62274 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rps29P62274 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rps29P62274 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rps29P62274 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rps29P62274 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rps29P62274 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rps29P62274 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rps29P62274 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rps29P62274 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rps29P62274 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rps29P62274 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rps29P62274 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rps29P62274 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rps29P62274 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rps29P62274 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rps29P62274 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rps29P62274 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rps29P62274 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rps29P62274 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rps29P62274 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rps29P62274 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rps29P62274 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rps29P62274 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rps29P62274 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rps29P62274 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rps29P62274 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps29P62274 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps29P62274 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps29P62274 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps29P62274 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps29P62274 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps29P62274 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps29P62274 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps29P62274 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps29P62274 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps29P62274 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps29P62274 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps29P62274 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps29P62274 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps29P62274 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps29P62274 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps29P62274 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps29P62274 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps29P62274 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps29P62274 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps29P62274 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps29P62274 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps29P62274 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps29P62274 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps29P62274 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rps29P62274 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rps29P62274 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rps29P62274 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rps29P62274 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rps29P62274 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rps29P62274 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rps29P62274 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rps29P62274 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rps29P62274 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rps29P62274 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rps29P62274 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rps29P62274 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rps29P62274 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rps29P62274 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rps29P62274 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rps29P62274 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rps29P62274 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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