Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2iP60898 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2iP60898 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2iP60898 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2iP60898 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2iP60898 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2iP60898 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2iP60898 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2iP60898 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2iP60898 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2iP60898 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2iP60898 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2iP60898 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2iP60898 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2iP60898 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2iP60898 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2iP60898 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr2iP60898 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr2iP60898 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2iP60898 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2iP60898 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2iP60898 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2iP60898 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2iP60898 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2iP60898 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2iP60898 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2iP60898 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2iP60898 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2iP60898 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2iP60898 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2iP60898 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2iP60898 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2iP60898 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2iP60898 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2iP60898 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Polr2iP60898 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Polr2iP60898 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2iP60898 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2iP60898 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2iP60898 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2iP60898 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2iP60898 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2iP60898 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2iP60898 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2iP60898 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2iP60898 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2iP60898 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2iP60898 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2iP60898 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2iP60898 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2iP60898 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2iP60898 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2iP60898 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2iP60898 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2iP60898 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2iP60898 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2iP60898 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2iP60898 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2iP60898 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2iP60898 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2iP60898 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2iP60898 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr2iP60898 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr2iP60898 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr2iP60898 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr2iP60898 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2iP60898 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2iP60898 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2iP60898 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2iP60898 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2iP60898 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2iP60898 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2iP60898 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2iP60898 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2iP60898 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2iP60898 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2iP60898 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2iP60898 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2iP60898 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2iP60898 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2iP60898 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2iP60898 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2iP60898 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2iP60898 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2iP60898 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2iP60898 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2iP60898 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2iP60898 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2iP60898 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr2iP60898 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr2iP60898 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr2iP60898 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2iP60898 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2iP60898 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2iP60898 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2iP60898 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2iP60898 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2iP60898 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2iP60898 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2iP60898 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms