Protein–RNA interactions for Protein: P60330

Espl1, Separin, mousemouse

Predictions only

Length 2,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Espl1P60330 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Espl1P60330 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Espl1P60330 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Espl1P60330 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Espl1P60330 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Espl1P60330 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Espl1P60330 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Espl1P60330 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Espl1P60330 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Espl1P60330 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Espl1P60330 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Espl1P60330 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Espl1P60330 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Espl1P60330 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Espl1P60330 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Espl1P60330 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Espl1P60330 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Espl1P60330 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Espl1P60330 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Espl1P60330 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Espl1P60330 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Espl1P60330 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Espl1P60330 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Espl1P60330 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Espl1P60330 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Espl1P60330 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Espl1P60330 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Espl1P60330 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Espl1P60330 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Espl1P60330 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Espl1P60330 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Espl1P60330 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Espl1P60330 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Espl1P60330 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Espl1P60330 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Espl1P60330 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Espl1P60330 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Espl1P60330 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Espl1P60330 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Espl1P60330 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Espl1P60330 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Espl1P60330 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Espl1P60330 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Espl1P60330 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Espl1P60330 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Espl1P60330 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Espl1P60330 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Espl1P60330 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Espl1P60330 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Espl1P60330 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Espl1P60330 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Espl1P60330 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Espl1P60330 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Espl1P60330 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Espl1P60330 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Espl1P60330 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Espl1P60330 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Espl1P60330 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Espl1P60330 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Espl1P60330 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Espl1P60330 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Espl1P60330 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Espl1P60330 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Espl1P60330 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Espl1P60330 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Espl1P60330 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Espl1P60330 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Espl1P60330 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Espl1P60330 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Espl1P60330 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Espl1P60330 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Espl1P60330 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Espl1P60330 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Espl1P60330 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Espl1P60330 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Espl1P60330 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Espl1P60330 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Espl1P60330 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Espl1P60330 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Espl1P60330 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Espl1P60330 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Espl1P60330 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Espl1P60330 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Espl1P60330 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Espl1P60330 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Espl1P60330 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Espl1P60330 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Espl1P60330 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Espl1P60330 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Espl1P60330 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Espl1P60330 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Espl1P60330 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Espl1P60330 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Espl1P60330 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Espl1P60330 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Espl1P60330 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Espl1P60330 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Espl1P60330 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Espl1P60330 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Espl1P60330 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms