Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr3bP59470 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr3bP59470 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr3bP59470 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr3bP59470 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr3bP59470 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Polr3bP59470 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Polr3bP59470 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Polr3bP59470 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Polr3bP59470 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr3bP59470 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr3bP59470 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr3bP59470 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr3bP59470 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr3bP59470 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr3bP59470 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr3bP59470 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr3bP59470 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr3bP59470 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Polr3bP59470 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Polr3bP59470 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr3bP59470 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr3bP59470 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr3bP59470 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr3bP59470 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr3bP59470 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr3bP59470 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr3bP59470 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Polr3bP59470 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Polr3bP59470 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr3bP59470 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr3bP59470 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr3bP59470 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr3bP59470 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr3bP59470 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr3bP59470 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr3bP59470 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr3bP59470 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr3bP59470 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr3bP59470 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr3bP59470 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr3bP59470 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr3bP59470 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr3bP59470 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr3bP59470 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr3bP59470 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr3bP59470 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr3bP59470 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr3bP59470 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr3bP59470 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr3bP59470 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr3bP59470 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr3bP59470 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr3bP59470 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr3bP59470 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr3bP59470 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr3bP59470 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr3bP59470 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr3bP59470 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Polr3bP59470 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Polr3bP59470 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Polr3bP59470 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Polr3bP59470 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Polr3bP59470 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Polr3bP59470 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr3bP59470 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr3bP59470 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr3bP59470 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr3bP59470 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr3bP59470 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr3bP59470 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr3bP59470 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr3bP59470 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr3bP59470 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Polr3bP59470 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Polr3bP59470 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Polr3bP59470 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Polr3bP59470 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr3bP59470 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr3bP59470 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr3bP59470 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr3bP59470 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr3bP59470 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr3bP59470 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr3bP59470 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr3bP59470 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr3bP59470 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr3bP59470 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr3bP59470 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr3bP59470 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr3bP59470 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr3bP59470 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr3bP59470 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr3bP59470 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr3bP59470 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr3bP59470 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr3bP59470 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr3bP59470 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr3bP59470 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr3bP59470 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms