Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtdsplP58465 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtdsplP58465 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtdsplP58465 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtdsplP58465 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtdsplP58465 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtdsplP58465 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtdsplP58465 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtdsplP58465 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtdsplP58465 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtdsplP58465 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtdsplP58465 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtdsplP58465 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtdsplP58465 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtdsplP58465 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtdsplP58465 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtdsplP58465 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtdsplP58465 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtdsplP58465 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtdsplP58465 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtdsplP58465 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CtdsplP58465 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CtdsplP58465 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtdsplP58465 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtdsplP58465 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtdsplP58465 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CtdsplP58465 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CtdsplP58465 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtdsplP58465 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtdsplP58465 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtdsplP58465 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtdsplP58465 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtdsplP58465 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtdsplP58465 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CtdsplP58465 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CtdsplP58465 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CtdsplP58465 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CtdsplP58465 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CtdsplP58465 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CtdsplP58465 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CtdsplP58465 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CtdsplP58465 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CtdsplP58465 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CtdsplP58465 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CtdsplP58465 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CtdsplP58465 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CtdsplP58465 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CtdsplP58465 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CtdsplP58465 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CtdsplP58465 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CtdsplP58465 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CtdsplP58465 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CtdsplP58465 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CtdsplP58465 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CtdsplP58465 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CtdsplP58465 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CtdsplP58465 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CtdsplP58465 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CtdsplP58465 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CtdsplP58465 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CtdsplP58465 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CtdsplP58465 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CtdsplP58465 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CtdsplP58465 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CtdsplP58465 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CtdsplP58465 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CtdsplP58465 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CtdsplP58465 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CtdsplP58465 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CtdsplP58465 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CtdsplP58465 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CtdsplP58465 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CtdsplP58465 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CtdsplP58465 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CtdsplP58465 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CtdsplP58465 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CtdsplP58465 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CtdsplP58465 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CtdsplP58465 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CtdsplP58465 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CtdsplP58465 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CtdsplP58465 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CtdsplP58465 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtdsplP58465 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtdsplP58465 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtdsplP58465 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtdsplP58465 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtdsplP58465 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtdsplP58465 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtdsplP58465 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CtdsplP58465 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CtdsplP58465 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CtdsplP58465 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CtdsplP58465 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CtdsplP58465 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtdsplP58465 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtdsplP58465 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtdsplP58465 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtdsplP58465 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtdsplP58465 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms