Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rp1P56716 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rp1P56716 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rp1P56716 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Rp1P56716 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rp1P56716 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rp1P56716 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rp1P56716 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rp1P56716 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rp1P56716 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rp1P56716 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rp1P56716 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rp1P56716 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rp1P56716 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rp1P56716 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rp1P56716 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rp1P56716 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rp1P56716 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rp1P56716 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rp1P56716 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rp1P56716 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rp1P56716 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rp1P56716 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rp1P56716 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rp1P56716 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rp1P56716 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rp1P56716 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rp1P56716 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rp1P56716 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rp1P56716 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rp1P56716 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rp1P56716 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rp1P56716 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rp1P56716 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rp1P56716 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rp1P56716 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rp1P56716 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rp1P56716 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rp1P56716 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rp1P56716 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rp1P56716 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rp1P56716 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rp1P56716 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rp1P56716 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rp1P56716 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rp1P56716 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rp1P56716 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rp1P56716 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rp1P56716 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rp1P56716 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rp1P56716 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rp1P56716 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rp1P56716 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rp1P56716 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rp1P56716 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rp1P56716 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rp1P56716 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rp1P56716 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rp1P56716 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rp1P56716 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rp1P56716 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rp1P56716 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rp1P56716 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rp1P56716 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rp1P56716 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rp1P56716 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rp1P56716 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rp1P56716 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rp1P56716 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rp1P56716 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rp1P56716 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rp1P56716 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rp1P56716 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rp1P56716 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rp1P56716 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rp1P56716 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rp1P56716 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rp1P56716 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rp1P56716 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rp1P56716 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rp1P56716 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rp1P56716 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rp1P56716 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rp1P56716 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rp1P56716 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rp1P56716 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rp1P56716 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rp1P56716 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rp1P56716 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rp1P56716 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rp1P56716 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rp1P56716 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rp1P56716 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rp1P56716 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rp1P56716 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rp1P56716 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rp1P56716 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rp1P56716 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rp1P56716 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rp1P56716 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms