Protein–RNA interactions for Protein: P54254

Atxn1, Ataxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn1P54254 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atxn1P54254 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atxn1P54254 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atxn1P54254 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atxn1P54254 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atxn1P54254 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atxn1P54254 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atxn1P54254 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atxn1P54254 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atxn1P54254 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atxn1P54254 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atxn1P54254 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atxn1P54254 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atxn1P54254 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atxn1P54254 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atxn1P54254 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atxn1P54254 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atxn1P54254 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atxn1P54254 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atxn1P54254 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Atxn1P54254 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atxn1P54254 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atxn1P54254 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atxn1P54254 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atxn1P54254 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atxn1P54254 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atxn1P54254 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atxn1P54254 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atxn1P54254 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atxn1P54254 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atxn1P54254 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atxn1P54254 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atxn1P54254 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atxn1P54254 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atxn1P54254 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atxn1P54254 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atxn1P54254 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atxn1P54254 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atxn1P54254 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atxn1P54254 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atxn1P54254 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn1P54254 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atxn1P54254 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atxn1P54254 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atxn1P54254 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atxn1P54254 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atxn1P54254 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atxn1P54254 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atxn1P54254 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atxn1P54254 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atxn1P54254 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atxn1P54254 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn1P54254 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn1P54254 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn1P54254 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn1P54254 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atxn1P54254 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atxn1P54254 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atxn1P54254 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atxn1P54254 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atxn1P54254 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atxn1P54254 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atxn1P54254 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atxn1P54254 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atxn1P54254 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Atxn1P54254 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atxn1P54254 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atxn1P54254 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atxn1P54254 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atxn1P54254 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atxn1P54254 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atxn1P54254 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atxn1P54254 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atxn1P54254 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atxn1P54254 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atxn1P54254 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atxn1P54254 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atxn1P54254 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atxn1P54254 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atxn1P54254 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atxn1P54254 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atxn1P54254 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atxn1P54254 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atxn1P54254 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atxn1P54254 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atxn1P54254 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atxn1P54254 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atxn1P54254 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atxn1P54254 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atxn1P54254 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atxn1P54254 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atxn1P54254 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atxn1P54254 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atxn1P54254 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atxn1P54254 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atxn1P54254 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atxn1P54254 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atxn1P54254 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atxn1P54254 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atxn1P54254 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms