Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PolgP54099 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PolgP54099 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PolgP54099 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PolgP54099 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PolgP54099 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PolgP54099 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PolgP54099 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PolgP54099 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PolgP54099 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PolgP54099 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PolgP54099 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PolgP54099 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PolgP54099 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PolgP54099 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PolgP54099 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PolgP54099 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PolgP54099 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PolgP54099 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PolgP54099 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PolgP54099 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PolgP54099 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PolgP54099 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PolgP54099 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PolgP54099 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PolgP54099 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PolgP54099 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PolgP54099 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PolgP54099 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PolgP54099 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PolgP54099 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PolgP54099 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PolgP54099 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PolgP54099 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PolgP54099 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PolgP54099 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PolgP54099 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PolgP54099 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PolgP54099 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PolgP54099 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PolgP54099 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PolgP54099 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PolgP54099 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PolgP54099 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PolgP54099 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PolgP54099 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PolgP54099 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PolgP54099 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PolgP54099 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PolgP54099 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PolgP54099 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PolgP54099 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PolgP54099 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PolgP54099 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PolgP54099 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PolgP54099 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PolgP54099 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PolgP54099 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PolgP54099 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PolgP54099 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PolgP54099 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PolgP54099 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PolgP54099 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PolgP54099 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PolgP54099 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PolgP54099 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PolgP54099 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PolgP54099 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PolgP54099 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PolgP54099 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PolgP54099 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PolgP54099 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PolgP54099 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PolgP54099 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PolgP54099 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PolgP54099 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PolgP54099 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PolgP54099 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PolgP54099 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PolgP54099 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PolgP54099 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PolgP54099 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PolgP54099 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PolgP54099 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PolgP54099 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PolgP54099 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PolgP54099 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PolgP54099 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PolgP54099 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PolgP54099 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PolgP54099 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PolgP54099 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PolgP54099 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PolgP54099 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PolgP54099 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PolgP54099 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PolgP54099 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PolgP54099 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PolgP54099 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PolgP54099 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms