Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Map3k1P53349 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Map3k1P53349 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Map3k1P53349 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Map3k1P53349 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Map3k1P53349 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Map3k1P53349 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Map3k1P53349 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Map3k1P53349 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
Map3k1P53349 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Map3k1P53349 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Map3k1P53349 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Map3k1P53349 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Map3k1P53349 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Map3k1P53349 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Map3k1P53349 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Map3k1P53349 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Map3k1P53349 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Map3k1P53349 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Map3k1P53349 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Map3k1P53349 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Map3k1P53349 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Map3k1P53349 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Map3k1P53349 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Map3k1P53349 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Map3k1P53349 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Map3k1P53349 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Map3k1P53349 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Map3k1P53349 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Map3k1P53349 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Map3k1P53349 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Map3k1P53349 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
Map3k1P53349 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Map3k1P53349 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Map3k1P53349 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Map3k1P53349 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Map3k1P53349 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Map3k1P53349 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Map3k1P53349 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Map3k1P53349 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Map3k1P53349 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Map3k1P53349 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Map3k1P53349 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Map3k1P53349 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Map3k1P53349 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Map3k1P53349 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Map3k1P53349 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Map3k1P53349 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Map3k1P53349 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
Map3k1P53349 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Map3k1P53349 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Map3k1P53349 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
Map3k1P53349 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Map3k1P53349 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Map3k1P53349 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Map3k1P53349 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Map3k1P53349 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Map3k1P53349 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Map3k1P53349 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Map3k1P53349 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Map3k1P53349 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Map3k1P53349 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Map3k1P53349 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Map3k1P53349 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Map3k1P53349 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Map3k1P53349 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
Map3k1P53349 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Map3k1P53349 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Map3k1P53349 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Map3k1P53349 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Map3k1P53349 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Map3k1P53349 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Map3k1P53349 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Map3k1P53349 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Map3k1P53349 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
Map3k1P53349 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Map3k1P53349 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Map3k1P53349 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Map3k1P53349 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Map3k1P53349 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Map3k1P53349 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
Map3k1P53349 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Map3k1P53349 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Map3k1P53349 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
Map3k1P53349 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Map3k1P53349 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Map3k1P53349 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Map3k1P53349 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Map3k1P53349 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Map3k1P53349 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Map3k1P53349 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Map3k1P53349 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Map3k1P53349 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Map3k1P53349 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Map3k1P53349 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Map3k1P53349 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Map3k1P53349 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Map3k1P53349 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Map3k1P53349 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Map3k1P53349 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms