Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RoraP51448 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RoraP51448 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RoraP51448 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RoraP51448 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RoraP51448 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RoraP51448 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RoraP51448 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RoraP51448 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RoraP51448 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RoraP51448 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RoraP51448 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RoraP51448 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RoraP51448 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RoraP51448 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RoraP51448 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RoraP51448 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RoraP51448 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RoraP51448 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RoraP51448 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RoraP51448 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RoraP51448 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RoraP51448 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RoraP51448 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RoraP51448 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RoraP51448 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RoraP51448 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RoraP51448 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RoraP51448 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RoraP51448 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RoraP51448 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RoraP51448 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RoraP51448 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RoraP51448 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RoraP51448 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RoraP51448 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RoraP51448 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RoraP51448 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RoraP51448 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RoraP51448 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RoraP51448 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RoraP51448 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RoraP51448 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RoraP51448 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RoraP51448 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RoraP51448 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RoraP51448 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RoraP51448 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RoraP51448 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RoraP51448 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RoraP51448 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RoraP51448 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RoraP51448 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RoraP51448 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RoraP51448 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RoraP51448 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RoraP51448 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RoraP51448 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RoraP51448 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RoraP51448 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RoraP51448 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RoraP51448 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RoraP51448 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RoraP51448 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RoraP51448 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RoraP51448 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
RoraP51448 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RoraP51448 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RoraP51448 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RoraP51448 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RoraP51448 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RoraP51448 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RoraP51448 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RoraP51448 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RoraP51448 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RoraP51448 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RoraP51448 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RoraP51448 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RoraP51448 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RoraP51448 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RoraP51448 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RoraP51448 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RoraP51448 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RoraP51448 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RoraP51448 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RoraP51448 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RoraP51448 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RoraP51448 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RoraP51448 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RoraP51448 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RoraP51448 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RoraP51448 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RoraP51448 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RoraP51448 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RoraP51448 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RoraP51448 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RoraP51448 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RoraP51448 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RoraP51448 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RoraP51448 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms