Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Defa8P50706 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Defa8P50706 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Defa8P50706 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Defa8P50706 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Defa8P50706 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Defa8P50706 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Defa8P50706 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Defa8P50706 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Defa8P50706 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Defa8P50706 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Defa8P50706 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Defa8P50706 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Defa8P50706 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Defa8P50706 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Defa8P50706 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Defa8P50706 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Defa8P50706 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Defa8P50706 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Defa8P50706 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Defa8P50706 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Defa8P50706 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Defa8P50706 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Defa8P50706 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Defa8P50706 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Defa8P50706 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Defa8P50706 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Defa8P50706 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Defa8P50706 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Defa8P50706 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Defa8P50706 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Defa8P50706 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Defa8P50706 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Defa8P50706 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Defa8P50706 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Defa8P50706 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Defa8P50706 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Defa8P50706 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Defa8P50706 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Defa8P50706 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Defa8P50706 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Defa8P50706 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Defa8P50706 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Defa8P50706 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Defa8P50706 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Defa8P50706 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Defa8P50706 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Defa8P50706 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Defa8P50706 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Defa8P50706 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Defa8P50706 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Defa8P50706 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Defa8P50706 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Defa8P50706 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Defa8P50706 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Defa8P50706 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Defa8P50706 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Defa8P50706 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Defa8P50706 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Defa8P50706 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Defa8P50706 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Defa8P50706 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Defa8P50706 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Defa8P50706 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Defa8P50706 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Defa8P50706 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Defa8P50706 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Defa8P50706 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Defa8P50706 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Defa8P50706 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Defa8P50706 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Defa8P50706 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Defa8P50706 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Defa8P50706 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Defa8P50706 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Defa8P50706 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Defa8P50706 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Defa8P50706 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Defa8P50706 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Defa8P50706 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Defa8P50706 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Defa8P50706 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Defa8P50706 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Defa8P50706 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Defa8P50706 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Defa8P50706 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Defa8P50706 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Defa8P50706 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Defa8P50706 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Defa8P50706 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Defa8P50706 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Defa8P50706 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Defa8P50706 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Defa8P50706 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Defa8P50706 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Defa8P50706 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Defa8P50706 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Defa8P50706 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Defa8P50706 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Defa8P50706 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms