Protein–RNA interactions for Protein: P50592

Tnfsf10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf10P50592 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfsf10P50592 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfsf10P50592 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf10P50592 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf10P50592 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf10P50592 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf10P50592 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsf10P50592 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfsf10P50592 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf10P50592 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf10P50592 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf10P50592 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsf10P50592 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsf10P50592 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsf10P50592 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsf10P50592 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsf10P50592 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsf10P50592 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsf10P50592 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfsf10P50592 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf10P50592 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf10P50592 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfsf10P50592 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfsf10P50592 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfsf10P50592 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfsf10P50592 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf10P50592 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf10P50592 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf10P50592 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf10P50592 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf10P50592 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf10P50592 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfsf10P50592 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfsf10P50592 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfsf10P50592 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfsf10P50592 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfsf10P50592 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf10P50592 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf10P50592 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf10P50592 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf10P50592 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfsf10P50592 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf10P50592 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf10P50592 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfsf10P50592 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfsf10P50592 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf10P50592 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf10P50592 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsf10P50592 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf10P50592 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf10P50592 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf10P50592 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsf10P50592 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfsf10P50592 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfsf10P50592 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfsf10P50592 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf10P50592 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf10P50592 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf10P50592 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf10P50592 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsf10P50592 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfsf10P50592 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfsf10P50592 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfsf10P50592 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfsf10P50592 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfsf10P50592 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfsf10P50592 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfsf10P50592 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfsf10P50592 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfsf10P50592 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfsf10P50592 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfsf10P50592 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfsf10P50592 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfsf10P50592 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfsf10P50592 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfsf10P50592 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfsf10P50592 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfsf10P50592 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfsf10P50592 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfsf10P50592 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfsf10P50592 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfsf10P50592 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfsf10P50592 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfsf10P50592 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfsf10P50592 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfsf10P50592 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfsf10P50592 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfsf10P50592 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfsf10P50592 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfsf10P50592 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfsf10P50592 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfsf10P50592 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfsf10P50592 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfsf10P50592 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfsf10P50592 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfsf10P50592 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfsf10P50592 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfsf10P50592 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfsf10P50592 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfsf10P50592 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms