Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tac1P41539 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tac1P41539 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tac1P41539 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tac1P41539 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tac1P41539 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tac1P41539 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tac1P41539 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tac1P41539 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tac1P41539 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tac1P41539 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tac1P41539 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tac1P41539 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tac1P41539 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tac1P41539 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tac1P41539 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tac1P41539 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tac1P41539 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tac1P41539 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tac1P41539 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tac1P41539 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tac1P41539 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tac1P41539 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tac1P41539 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tac1P41539 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tac1P41539 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tac1P41539 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tac1P41539 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tac1P41539 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tac1P41539 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tac1P41539 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tac1P41539 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tac1P41539 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tac1P41539 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tac1P41539 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tac1P41539 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tac1P41539 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tac1P41539 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tac1P41539 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tac1P41539 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tac1P41539 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tac1P41539 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tac1P41539 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tac1P41539 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tac1P41539 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tac1P41539 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tac1P41539 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tac1P41539 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tac1P41539 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tac1P41539 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tac1P41539 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tac1P41539 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tac1P41539 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tac1P41539 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tac1P41539 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tac1P41539 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tac1P41539 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tac1P41539 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tac1P41539 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tac1P41539 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tac1P41539 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tac1P41539 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tac1P41539 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tac1P41539 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tac1P41539 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tac1P41539 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tac1P41539 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tac1P41539 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tac1P41539 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tac1P41539 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tac1P41539 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tac1P41539 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tac1P41539 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tac1P41539 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tac1P41539 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tac1P41539 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tac1P41539 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tac1P41539 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tac1P41539 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tac1P41539 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tac1P41539 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tac1P41539 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tac1P41539 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tac1P41539 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tac1P41539 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tac1P41539 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tac1P41539 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tac1P41539 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tac1P41539 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tac1P41539 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tac1P41539 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tac1P41539 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tac1P41539 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tac1P41539 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tac1P41539 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tac1P41539 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tac1P41539 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tac1P41539 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tac1P41539 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tac1P41539 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms