Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csf3rP40223 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csf3rP40223 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csf3rP40223 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csf3rP40223 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Csf3rP40223 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Csf3rP40223 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Csf3rP40223 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Csf3rP40223 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Csf3rP40223 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csf3rP40223 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csf3rP40223 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csf3rP40223 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csf3rP40223 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csf3rP40223 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csf3rP40223 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csf3rP40223 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Csf3rP40223 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Csf3rP40223 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csf3rP40223 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csf3rP40223 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csf3rP40223 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csf3rP40223 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csf3rP40223 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csf3rP40223 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Csf3rP40223 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csf3rP40223 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Csf3rP40223 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csf3rP40223 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csf3rP40223 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csf3rP40223 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csf3rP40223 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csf3rP40223 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csf3rP40223 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Csf3rP40223 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csf3rP40223 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Csf3rP40223 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csf3rP40223 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csf3rP40223 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csf3rP40223 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csf3rP40223 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csf3rP40223 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csf3rP40223 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Csf3rP40223 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csf3rP40223 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csf3rP40223 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csf3rP40223 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Csf3rP40223 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csf3rP40223 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csf3rP40223 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csf3rP40223 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csf3rP40223 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Csf3rP40223 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Csf3rP40223 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Csf3rP40223 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Csf3rP40223 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Csf3rP40223 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Csf3rP40223 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Csf3rP40223 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Csf3rP40223 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Csf3rP40223 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Csf3rP40223 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csf3rP40223 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csf3rP40223 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csf3rP40223 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csf3rP40223 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csf3rP40223 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csf3rP40223 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csf3rP40223 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csf3rP40223 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csf3rP40223 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csf3rP40223 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Csf3rP40223 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csf3rP40223 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csf3rP40223 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csf3rP40223 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csf3rP40223 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csf3rP40223 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Csf3rP40223 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csf3rP40223 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csf3rP40223 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csf3rP40223 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csf3rP40223 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csf3rP40223 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csf3rP40223 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csf3rP40223 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Csf3rP40223 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csf3rP40223 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csf3rP40223 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csf3rP40223 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csf3rP40223 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csf3rP40223 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csf3rP40223 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csf3rP40223 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csf3rP40223 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csf3rP40223 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csf3rP40223 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csf3rP40223 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csf3rP40223 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csf3rP40223 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms