Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mmp12P34960 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp12P34960 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp12P34960 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp12P34960 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp12P34960 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp12P34960 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp12P34960 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mmp12P34960 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp12P34960 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp12P34960 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mmp12P34960 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mmp12P34960 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mmp12P34960 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mmp12P34960 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp12P34960 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp12P34960 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp12P34960 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp12P34960 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp12P34960 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp12P34960 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp12P34960 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mmp12P34960 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp12P34960 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp12P34960 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp12P34960 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp12P34960 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mmp12P34960 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mmp12P34960 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mmp12P34960 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mmp12P34960 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mmp12P34960 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mmp12P34960 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp12P34960 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp12P34960 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp12P34960 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp12P34960 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp12P34960 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp12P34960 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mmp12P34960 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Mmp12P34960 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mmp12P34960 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mmp12P34960 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp12P34960 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp12P34960 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp12P34960 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp12P34960 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp12P34960 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp12P34960 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp12P34960 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp12P34960 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp12P34960 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp12P34960 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp12P34960 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp12P34960 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp12P34960 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp12P34960 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp12P34960 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp12P34960 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp12P34960 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp12P34960 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp12P34960 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp12P34960 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp12P34960 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp12P34960 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp12P34960 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mmp12P34960 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp12P34960 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp12P34960 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp12P34960 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp12P34960 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp12P34960 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp12P34960 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp12P34960 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp12P34960 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp12P34960 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp12P34960 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp12P34960 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp12P34960 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp12P34960 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp12P34960 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp12P34960 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp12P34960 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp12P34960 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp12P34960 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp12P34960 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp12P34960 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp12P34960 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp12P34960 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp12P34960 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp12P34960 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp12P34960 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp12P34960 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp12P34960 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mmp12P34960 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp12P34960 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp12P34960 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp12P34960 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp12P34960 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp12P34960 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms