Protein–RNA interactions for Protein: P28293

Ctsg, Cathepsin G, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsgP28293 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsgP28293 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsgP28293 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsgP28293 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsgP28293 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsgP28293 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsgP28293 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsgP28293 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsgP28293 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsgP28293 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsgP28293 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsgP28293 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsgP28293 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsgP28293 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsgP28293 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsgP28293 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsgP28293 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtsgP28293 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsgP28293 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtsgP28293 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsgP28293 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsgP28293 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtsgP28293 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsgP28293 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsgP28293 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtsgP28293 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsgP28293 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsgP28293 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsgP28293 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsgP28293 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsgP28293 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsgP28293 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtsgP28293 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsgP28293 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsgP28293 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsgP28293 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsgP28293 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsgP28293 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsgP28293 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsgP28293 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsgP28293 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsgP28293 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsgP28293 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsgP28293 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsgP28293 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsgP28293 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsgP28293 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsgP28293 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsgP28293 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsgP28293 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsgP28293 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsgP28293 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsgP28293 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsgP28293 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsgP28293 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsgP28293 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsgP28293 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsgP28293 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsgP28293 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsgP28293 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsgP28293 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsgP28293 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsgP28293 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsgP28293 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsgP28293 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsgP28293 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsgP28293 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsgP28293 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsgP28293 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsgP28293 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsgP28293 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsgP28293 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsgP28293 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsgP28293 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsgP28293 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsgP28293 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsgP28293 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsgP28293 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsgP28293 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsgP28293 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsgP28293 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsgP28293 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsgP28293 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsgP28293 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsgP28293 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsgP28293 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CtsgP28293 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtsgP28293 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsgP28293 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsgP28293 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsgP28293 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsgP28293 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsgP28293 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsgP28293 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsgP28293 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsgP28293 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsgP28293 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsgP28293 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsgP28293 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsgP28293 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms