Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxd8P23463 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxd8P23463 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxd8P23463 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxd8P23463 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxd8P23463 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxd8P23463 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxd8P23463 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxd8P23463 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxd8P23463 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hoxd8P23463 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxd8P23463 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxd8P23463 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxd8P23463 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxd8P23463 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxd8P23463 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxd8P23463 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxd8P23463 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxd8P23463 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxd8P23463 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxd8P23463 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxd8P23463 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxd8P23463 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxd8P23463 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxd8P23463 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxd8P23463 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxd8P23463 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxd8P23463 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxd8P23463 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxd8P23463 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxd8P23463 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxd8P23463 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxd8P23463 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxd8P23463 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxd8P23463 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxd8P23463 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxd8P23463 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxd8P23463 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxd8P23463 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxd8P23463 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxd8P23463 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxd8P23463 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxd8P23463 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxd8P23463 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxd8P23463 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxd8P23463 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxd8P23463 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxd8P23463 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxd8P23463 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxd8P23463 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxd8P23463 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxd8P23463 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxd8P23463 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxd8P23463 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxd8P23463 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxd8P23463 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxd8P23463 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxd8P23463 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxd8P23463 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxd8P23463 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxd8P23463 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxd8P23463 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxd8P23463 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxd8P23463 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxd8P23463 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxd8P23463 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxd8P23463 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxd8P23463 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxd8P23463 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxd8P23463 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxd8P23463 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxd8P23463 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxd8P23463 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxd8P23463 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxd8P23463 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxd8P23463 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxd8P23463 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxd8P23463 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxd8P23463 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxd8P23463 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxd8P23463 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxd8P23463 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxd8P23463 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxd8P23463 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxd8P23463 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxd8P23463 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxd8P23463 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxd8P23463 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxd8P23463 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxd8P23463 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxd8P23463 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxd8P23463 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxd8P23463 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxd8P23463 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxd8P23463 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxd8P23463 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxd8P23463 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxd8P23463 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxd8P23463 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxd8P23463 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms