Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tpm3P21107 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tpm3P21107 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tpm3P21107 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tpm3P21107 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Tpm3P21107 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tpm3P21107 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tpm3P21107 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tpm3P21107 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tpm3P21107 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tpm3P21107 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tpm3P21107 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tpm3P21107 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tpm3P21107 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tpm3P21107 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tpm3P21107 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tpm3P21107 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tpm3P21107 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tpm3P21107 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tpm3P21107 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Tpm3P21107 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tpm3P21107 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tpm3P21107 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tpm3P21107 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tpm3P21107 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tpm3P21107 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tpm3P21107 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tpm3P21107 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tpm3P21107 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tpm3P21107 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tpm3P21107 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tpm3P21107 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tpm3P21107 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tpm3P21107 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tpm3P21107 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tpm3P21107 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tpm3P21107 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tpm3P21107 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tpm3P21107 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tpm3P21107 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tpm3P21107 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tpm3P21107 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tpm3P21107 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tpm3P21107 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tpm3P21107 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tpm3P21107 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tpm3P21107 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Tpm3P21107 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tpm3P21107 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tpm3P21107 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tpm3P21107 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tpm3P21107 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tpm3P21107 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tpm3P21107 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tpm3P21107 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tpm3P21107 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tpm3P21107 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tpm3P21107 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpm3P21107 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpm3P21107 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpm3P21107 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpm3P21107 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpm3P21107 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tpm3P21107 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tpm3P21107 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tpm3P21107 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tpm3P21107 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tpm3P21107 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tpm3P21107 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tpm3P21107 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tpm3P21107 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tpm3P21107 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tpm3P21107 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tpm3P21107 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tpm3P21107 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tpm3P21107 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tpm3P21107 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tpm3P21107 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tpm3P21107 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tpm3P21107 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tpm3P21107 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tpm3P21107 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tpm3P21107 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tpm3P21107 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tpm3P21107 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tpm3P21107 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tpm3P21107 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tpm3P21107 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tpm3P21107 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tpm3P21107 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tpm3P21107 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tpm3P21107 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tpm3P21107 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tpm3P21107 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tpm3P21107 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tpm3P21107 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tpm3P21107 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tpm3P21107 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tpm3P21107 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpm3P21107 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms