Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18527 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18527 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18527 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18527 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18527 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18527 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18527 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18527 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18527 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18527 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18527 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18527 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18527 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18527 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18527 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18527 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18527 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18527 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P18527 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P18527 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P18527 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P18527 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18527 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18527 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18527 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18527 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P18527 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P18527 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P18527 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
P18527 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
P18527 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P18527 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
P18527 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P18527 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P18527 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P18527 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P18527 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P18527 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P18527 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P18527 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P18527 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P18527 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P18527 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P18527 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P18527 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18527 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18527 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18527 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18527 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18527 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18527 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18527 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18527 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18527 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18527 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18527 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18527 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18527 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18527 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18527 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18527 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18527 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18527 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P18527 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P18527 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P18527 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P18527 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P18527 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P18527 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P18527 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P18527 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P18527 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P18527 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P18527 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P18527 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P18527 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P18527 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P18527 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P18527 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
P18527 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P18527 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P18527 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
P18527 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
P18527 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
P18527 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
P18527 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P18527 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P18527 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P18527 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P18527 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18527 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18527 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18527 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18527 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18527 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18527 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18527 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18527 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18527 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms