Protein–RNA interactions for Protein: P15375

Myf6, Myogenic factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf6P15375 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myf6P15375 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myf6P15375 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myf6P15375 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myf6P15375 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myf6P15375 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myf6P15375 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myf6P15375 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myf6P15375 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myf6P15375 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Myf6P15375 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myf6P15375 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myf6P15375 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Myf6P15375 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Myf6P15375 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Myf6P15375 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myf6P15375 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myf6P15375 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myf6P15375 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myf6P15375 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myf6P15375 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Myf6P15375 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myf6P15375 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myf6P15375 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myf6P15375 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myf6P15375 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myf6P15375 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myf6P15375 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myf6P15375 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myf6P15375 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myf6P15375 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myf6P15375 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myf6P15375 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myf6P15375 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myf6P15375 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myf6P15375 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myf6P15375 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myf6P15375 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myf6P15375 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myf6P15375 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myf6P15375 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myf6P15375 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myf6P15375 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myf6P15375 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myf6P15375 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myf6P15375 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myf6P15375 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myf6P15375 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myf6P15375 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myf6P15375 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myf6P15375 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myf6P15375 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Myf6P15375 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myf6P15375 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myf6P15375 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myf6P15375 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myf6P15375 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Myf6P15375 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myf6P15375 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Myf6P15375 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myf6P15375 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myf6P15375 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myf6P15375 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myf6P15375 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Myf6P15375 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myf6P15375 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myf6P15375 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myf6P15375 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myf6P15375 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myf6P15375 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myf6P15375 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myf6P15375 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myf6P15375 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myf6P15375 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myf6P15375 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myf6P15375 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myf6P15375 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Myf6P15375 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myf6P15375 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myf6P15375 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myf6P15375 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myf6P15375 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Myf6P15375 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myf6P15375 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Myf6P15375 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myf6P15375 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myf6P15375 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myf6P15375 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myf6P15375 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myf6P15375 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myf6P15375 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myf6P15375 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myf6P15375 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myf6P15375 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myf6P15375 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Myf6P15375 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myf6P15375 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myf6P15375 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myf6P15375 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myf6P15375 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms