Protein–RNA interactions for Protein: P13412

Tnni2, Troponin I, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni2P13412 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Tnni2P13412 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Tnni2P13412 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Tnni2P13412 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Tnni2P13412 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,24
Tnni2P13412 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,24
Tnni2P13412 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Tnni2P13412 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,99■■■□□ 2,23
Tnni2P13412 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Tnni2P13412 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Tnni2P13412 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Tnni2P13412 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Tnni2P13412 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Tnni2P13412 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28,96■■■□□ 2,23
Tnni2P13412 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Tnni2P13412 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Tnni2P13412 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Tnni2P13412 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Tnni2P13412 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Tnni2P13412 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28,9■■■□□ 2,22
Tnni2P13412 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Tnni2P13412 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28,89■■■□□ 2,21
Tnni2P13412 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Tnni2P13412 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Tnni2P13412 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Tnni2P13412 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Tnni2P13412 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Tnni2P13412 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Tnni2P13412 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Tnni2P13412 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Tnni2P13412 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Tnni2P13412 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Tnni2P13412 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Tnni2P13412 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Tnni2P13412 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Tnni2P13412 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Tnni2P13412 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Tnni2P13412 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Tnni2P13412 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Tnni2P13412 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Tnni2P13412 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Tnni2P13412 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Tnni2P13412 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Tnni2P13412 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Tnni2P13412 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28,81■■■□□ 2,2
Tnni2P13412 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28,81■■■□□ 2,2
Tnni2P13412 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Tnni2P13412 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Tnni2P13412 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Tnni2P13412 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Tnni2P13412 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Tnni2P13412 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Tnni2P13412 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Tnni2P13412 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Tnni2P13412 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Tnni2P13412 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Tnni2P13412 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Tnni2P13412 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Tnni2P13412 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Tnni2P13412 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Tnni2P13412 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Tnni2P13412 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Tnni2P13412 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Tnni2P13412 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Tnni2P13412 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Tnni2P13412 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Tnni2P13412 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Tnni2P13412 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28,71■■■□□ 2,19
Tnni2P13412 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Tnni2P13412 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Tnni2P13412 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Tnni2P13412 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Tnni2P13412 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Tnni2P13412 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Tnni2P13412 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Tnni2P13412 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Tnni2P13412 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Tnni2P13412 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Tnni2P13412 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Tnni2P13412 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Tnni2P13412 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Tnni2P13412 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Tnni2P13412 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Tnni2P13412 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Tnni2P13412 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Tnni2P13412 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Tnni2P13412 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Tnni2P13412 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Tnni2P13412 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Tnni2P13412 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Tnni2P13412 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Tnni2P13412 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Tnni2P13412 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Tnni2P13412 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28,58■■■□□ 2,17
Tnni2P13412 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Tnni2P13412 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Tnni2P13412 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Tnni2P13412 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
Tnni2P13412 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Tnni2P13412 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms