Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PolP11369 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PolP11369 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PolP11369 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PolP11369 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PolP11369 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PolP11369 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PolP11369 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PolP11369 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PolP11369 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PolP11369 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PolP11369 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PolP11369 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PolP11369 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PolP11369 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PolP11369 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PolP11369 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PolP11369 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PolP11369 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PolP11369 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PolP11369 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PolP11369 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PolP11369 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PolP11369 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PolP11369 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PolP11369 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PolP11369 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PolP11369 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PolP11369 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PolP11369 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PolP11369 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PolP11369 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PolP11369 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PolP11369 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PolP11369 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PolP11369 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PolP11369 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PolP11369 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PolP11369 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PolP11369 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PolP11369 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PolP11369 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PolP11369 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PolP11369 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PolP11369 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PolP11369 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PolP11369 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PolP11369 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PolP11369 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PolP11369 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PolP11369 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PolP11369 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PolP11369 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PolP11369 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PolP11369 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PolP11369 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PolP11369 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PolP11369 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PolP11369 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PolP11369 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PolP11369 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PolP11369 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PolP11369 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PolP11369 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PolP11369 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PolP11369 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PolP11369 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PolP11369 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PolP11369 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PolP11369 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PolP11369 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PolP11369 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PolP11369 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PolP11369 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PolP11369 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PolP11369 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PolP11369 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PolP11369 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PolP11369 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PolP11369 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PolP11369 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PolP11369 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PolP11369 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PolP11369 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PolP11369 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PolP11369 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PolP11369 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PolP11369 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PolP11369 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PolP11369 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PolP11369 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PolP11369 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PolP11369 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PolP11369 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PolP11369 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PolP11369 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PolP11369 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PolP11369 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PolP11369 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PolP11369 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms