Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxcl2P10889 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxcl2P10889 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cxcl2P10889 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cxcl2P10889 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcl2P10889 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcl2P10889 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcl2P10889 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcl2P10889 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcl2P10889 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcl2P10889 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxcl2P10889 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcl2P10889 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcl2P10889 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcl2P10889 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcl2P10889 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcl2P10889 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcl2P10889 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcl2P10889 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcl2P10889 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cxcl2P10889 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cxcl2P10889 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cxcl2P10889 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcl2P10889 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcl2P10889 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcl2P10889 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cxcl2P10889 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cxcl2P10889 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cxcl2P10889 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cxcl2P10889 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cxcl2P10889 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cxcl2P10889 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcl2P10889 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcl2P10889 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cxcl2P10889 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cxcl2P10889 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cxcl2P10889 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cxcl2P10889 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcl2P10889 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcl2P10889 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcl2P10889 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcl2P10889 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cxcl2P10889 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cxcl2P10889 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cxcl2P10889 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cxcl2P10889 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cxcl2P10889 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cxcl2P10889 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cxcl2P10889 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cxcl2P10889 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cxcl2P10889 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cxcl2P10889 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cxcl2P10889 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcl2P10889 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcl2P10889 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cxcl2P10889 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxcl2P10889 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxcl2P10889 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxcl2P10889 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxcl2P10889 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxcl2P10889 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxcl2P10889 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcl2P10889 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcl2P10889 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcl2P10889 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcl2P10889 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcl2P10889 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcl2P10889 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcl2P10889 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcl2P10889 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcl2P10889 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcl2P10889 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcl2P10889 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms