Protein–RNA interactions for Protein: P0DP26

Calm1, Calmodulin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm1P0DP26 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Calm1P0DP26 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Calm1P0DP26 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Calm1P0DP26 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Calm1P0DP26 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Calm1P0DP26 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Calm1P0DP26 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Calm1P0DP26 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Calm1P0DP26 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Calm1P0DP26 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Calm1P0DP26 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Calm1P0DP26 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Calm1P0DP26 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Calm1P0DP26 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Calm1P0DP26 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Calm1P0DP26 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Calm1P0DP26 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Calm1P0DP26 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Calm1P0DP26 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Calm1P0DP26 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Calm1P0DP26 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Calm1P0DP26 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Calm1P0DP26 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Calm1P0DP26 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Calm1P0DP26 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Calm1P0DP26 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Calm1P0DP26 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Calm1P0DP26 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Calm1P0DP26 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Calm1P0DP26 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Calm1P0DP26 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Calm1P0DP26 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Calm1P0DP26 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Calm1P0DP26 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Calm1P0DP26 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Calm1P0DP26 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Calm1P0DP26 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Calm1P0DP26 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Calm1P0DP26 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Calm1P0DP26 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Calm1P0DP26 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Calm1P0DP26 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Calm1P0DP26 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Calm1P0DP26 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Calm1P0DP26 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Calm1P0DP26 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Calm1P0DP26 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Calm1P0DP26 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Calm1P0DP26 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Calm1P0DP26 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Calm1P0DP26 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Calm1P0DP26 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Calm1P0DP26 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Calm1P0DP26 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Calm1P0DP26 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Calm1P0DP26 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Calm1P0DP26 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Calm1P0DP26 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Calm1P0DP26 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Calm1P0DP26 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Calm1P0DP26 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Calm1P0DP26 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Calm1P0DP26 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Calm1P0DP26 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Calm1P0DP26 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Calm1P0DP26 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Calm1P0DP26 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Calm1P0DP26 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Calm1P0DP26 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Calm1P0DP26 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Calm1P0DP26 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Calm1P0DP26 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Calm1P0DP26 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Calm1P0DP26 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Calm1P0DP26 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Calm1P0DP26 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Calm1P0DP26 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Calm1P0DP26 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Calm1P0DP26 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Calm1P0DP26 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Calm1P0DP26 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Calm1P0DP26 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Calm1P0DP26 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Calm1P0DP26 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Calm1P0DP26 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Calm1P0DP26 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Calm1P0DP26 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Calm1P0DP26 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Calm1P0DP26 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Calm1P0DP26 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Calm1P0DP26 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Calm1P0DP26 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Calm1P0DP26 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Calm1P0DP26 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Calm1P0DP26 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Calm1P0DP26 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Calm1P0DP26 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Calm1P0DP26 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Calm1P0DP26 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Calm1P0DP26 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms